Protein–RNA interactions for Protein: P15374

UCHL3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UCHL3P15374 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
UCHL3P15374 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UCHL3P15374 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
UCHL3P15374 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UCHL3P15374 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UCHL3P15374 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UCHL3P15374 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UCHL3P15374 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UCHL3P15374 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UCHL3P15374 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UCHL3P15374 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
UCHL3P15374 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
UCHL3P15374 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UCHL3P15374 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UCHL3P15374 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
UCHL3P15374 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UCHL3P15374 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UCHL3P15374 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UCHL3P15374 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UCHL3P15374 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UCHL3P15374 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UCHL3P15374 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UCHL3P15374 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UCHL3P15374 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UCHL3P15374 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UCHL3P15374 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UCHL3P15374 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
UCHL3P15374 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
UCHL3P15374 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
UCHL3P15374 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
UCHL3P15374 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
UCHL3P15374 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UCHL3P15374 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UCHL3P15374 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UCHL3P15374 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
UCHL3P15374 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
UCHL3P15374 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
UCHL3P15374 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UCHL3P15374 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UCHL3P15374 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
UCHL3P15374 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UCHL3P15374 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UCHL3P15374 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UCHL3P15374 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UCHL3P15374 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
UCHL3P15374 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UCHL3P15374 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UCHL3P15374 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UCHL3P15374 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UCHL3P15374 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
UCHL3P15374 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UCHL3P15374 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UCHL3P15374 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
UCHL3P15374 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
UCHL3P15374 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UCHL3P15374 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
UCHL3P15374 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UCHL3P15374 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UCHL3P15374 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
UCHL3P15374 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
UCHL3P15374 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
UCHL3P15374 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UCHL3P15374 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UCHL3P15374 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UCHL3P15374 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
UCHL3P15374 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UCHL3P15374 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
UCHL3P15374 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UCHL3P15374 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UCHL3P15374 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UCHL3P15374 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UCHL3P15374 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
UCHL3P15374 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
UCHL3P15374 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UCHL3P15374 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UCHL3P15374 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UCHL3P15374 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UCHL3P15374 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UCHL3P15374 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UCHL3P15374 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UCHL3P15374 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UCHL3P15374 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UCHL3P15374 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UCHL3P15374 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UCHL3P15374 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
UCHL3P15374 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
UCHL3P15374 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UCHL3P15374 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
UCHL3P15374 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
UCHL3P15374 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
UCHL3P15374 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
UCHL3P15374 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
UCHL3P15374 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
UCHL3P15374 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
UCHL3P15374 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
UCHL3P15374 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UCHL3P15374 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
UCHL3P15374 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
UCHL3P15374 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UCHL3P15374 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms