Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEFHP12036 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEFHP12036 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEFHP12036 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEFHP12036 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEFHP12036 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEFHP12036 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEFHP12036 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEFHP12036 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEFHP12036 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEFHP12036 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEFHP12036 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEFHP12036 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEFHP12036 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NEFHP12036 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEFHP12036 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEFHP12036 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEFHP12036 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEFHP12036 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEFHP12036 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEFHP12036 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEFHP12036 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEFHP12036 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEFHP12036 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEFHP12036 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEFHP12036 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEFHP12036 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEFHP12036 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEFHP12036 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEFHP12036 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEFHP12036 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEFHP12036 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEFHP12036 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEFHP12036 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEFHP12036 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEFHP12036 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEFHP12036 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEFHP12036 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NEFHP12036 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEFHP12036 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEFHP12036 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEFHP12036 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEFHP12036 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEFHP12036 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEFHP12036 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEFHP12036 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEFHP12036 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEFHP12036 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEFHP12036 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NEFHP12036 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEFHP12036 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEFHP12036 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEFHP12036 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEFHP12036 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEFHP12036 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEFHP12036 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEFHP12036 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEFHP12036 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEFHP12036 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEFHP12036 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEFHP12036 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEFHP12036 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEFHP12036 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEFHP12036 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEFHP12036 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEFHP12036 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEFHP12036 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEFHP12036 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEFHP12036 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NEFHP12036 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEFHP12036 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEFHP12036 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEFHP12036 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEFHP12036 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEFHP12036 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEFHP12036 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEFHP12036 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEFHP12036 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEFHP12036 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEFHP12036 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEFHP12036 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEFHP12036 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEFHP12036 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEFHP12036 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEFHP12036 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEFHP12036 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEFHP12036 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEFHP12036 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEFHP12036 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEFHP12036 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEFHP12036 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEFHP12036 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEFHP12036 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NEFHP12036 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEFHP12036 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEFHP12036 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEFHP12036 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEFHP12036 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NEFHP12036 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEFHP12036 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms