Protein–RNA interactions for Protein: P11940

PABPC1, Polyadenylate-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1P11940 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PABPC1P11940 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PABPC1P11940 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PABPC1P11940 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PABPC1P11940 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PABPC1P11940 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PABPC1P11940 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PABPC1P11940 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PABPC1P11940 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PABPC1P11940 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PABPC1P11940 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PABPC1P11940 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PABPC1P11940 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PABPC1P11940 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PABPC1P11940 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PABPC1P11940 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PABPC1P11940 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PABPC1P11940 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PABPC1P11940 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PABPC1P11940 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PABPC1P11940 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PABPC1P11940 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PABPC1P11940 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PABPC1P11940 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PABPC1P11940 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PABPC1P11940 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PABPC1P11940 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PABPC1P11940 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PABPC1P11940 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PABPC1P11940 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PABPC1P11940 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PABPC1P11940 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PABPC1P11940 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PABPC1P11940 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PABPC1P11940 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PABPC1P11940 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PABPC1P11940 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PABPC1P11940 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PABPC1P11940 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PABPC1P11940 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PABPC1P11940 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PABPC1P11940 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PABPC1P11940 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PABPC1P11940 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PABPC1P11940 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PABPC1P11940 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PABPC1P11940 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PABPC1P11940 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PABPC1P11940 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PABPC1P11940 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PABPC1P11940 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PABPC1P11940 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PABPC1P11940 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PABPC1P11940 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PABPC1P11940 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PABPC1P11940 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PABPC1P11940 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PABPC1P11940 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PABPC1P11940 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PABPC1P11940 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PABPC1P11940 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PABPC1P11940 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PABPC1P11940 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PABPC1P11940 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PABPC1P11940 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PABPC1P11940 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PABPC1P11940 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PABPC1P11940 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PABPC1P11940 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PABPC1P11940 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PABPC1P11940 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PABPC1P11940 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PABPC1P11940 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PABPC1P11940 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PABPC1P11940 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PABPC1P11940 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PABPC1P11940 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PABPC1P11940 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PABPC1P11940 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PABPC1P11940 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PABPC1P11940 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PABPC1P11940 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PABPC1P11940 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PABPC1P11940 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PABPC1P11940 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PABPC1P11940 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PABPC1P11940 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PABPC1P11940 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PABPC1P11940 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PABPC1P11940 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PABPC1P11940 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PABPC1P11940 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PABPC1P11940 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PABPC1P11940 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PABPC1P11940 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PABPC1P11940 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PABPC1P11940 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PABPC1P11940 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PABPC1P11940 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PABPC1P11940 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms