Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RARBP10826 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RARBP10826 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RARBP10826 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RARBP10826 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RARBP10826 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RARBP10826 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RARBP10826 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RARBP10826 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RARBP10826 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RARBP10826 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RARBP10826 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RARBP10826 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RARBP10826 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RARBP10826 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RARBP10826 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RARBP10826 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RARBP10826 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RARBP10826 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RARBP10826 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RARBP10826 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RARBP10826 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RARBP10826 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RARBP10826 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RARBP10826 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RARBP10826 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RARBP10826 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RARBP10826 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RARBP10826 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RARBP10826 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RARBP10826 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
RARBP10826 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RARBP10826 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RARBP10826 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RARBP10826 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RARBP10826 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RARBP10826 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RARBP10826 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RARBP10826 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RARBP10826 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RARBP10826 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RARBP10826 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RARBP10826 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RARBP10826 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RARBP10826 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
RARBP10826 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RARBP10826 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RARBP10826 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RARBP10826 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RARBP10826 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RARBP10826 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RARBP10826 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
RARBP10826 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RARBP10826 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RARBP10826 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RARBP10826 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RARBP10826 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RARBP10826 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RARBP10826 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RARBP10826 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RARBP10826 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RARBP10826 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RARBP10826 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
RARBP10826 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RARBP10826 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RARBP10826 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RARBP10826 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RARBP10826 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RARBP10826 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RARBP10826 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RARBP10826 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RARBP10826 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RARBP10826 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RARBP10826 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RARBP10826 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RARBP10826 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RARBP10826 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RARBP10826 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RARBP10826 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RARBP10826 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RARBP10826 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RARBP10826 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RARBP10826 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RARBP10826 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RARBP10826 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
RARBP10826 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RARBP10826 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RARBP10826 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RARBP10826 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RARBP10826 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RARBP10826 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RARBP10826 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RARBP10826 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RARBP10826 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RARBP10826 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RARBP10826 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RARBP10826 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RARBP10826 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RARBP10826 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RARBP10826 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms