Protein–RNA interactions for Protein: P0CG08

GPR89B, Golgi pH regulator B, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR89BP0CG08 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPR89BP0CG08 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPR89BP0CG08 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPR89BP0CG08 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GPR89BP0CG08 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPR89BP0CG08 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPR89BP0CG08 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPR89BP0CG08 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPR89BP0CG08 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPR89BP0CG08 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPR89BP0CG08 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPR89BP0CG08 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPR89BP0CG08 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GPR89BP0CG08 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPR89BP0CG08 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPR89BP0CG08 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPR89BP0CG08 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPR89BP0CG08 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GPR89BP0CG08 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GPR89BP0CG08 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPR89BP0CG08 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPR89BP0CG08 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPR89BP0CG08 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPR89BP0CG08 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPR89BP0CG08 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPR89BP0CG08 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPR89BP0CG08 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPR89BP0CG08 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPR89BP0CG08 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPR89BP0CG08 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GPR89BP0CG08 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPR89BP0CG08 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPR89BP0CG08 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GPR89BP0CG08 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPR89BP0CG08 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPR89BP0CG08 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GPR89BP0CG08 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPR89BP0CG08 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPR89BP0CG08 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPR89BP0CG08 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPR89BP0CG08 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPR89BP0CG08 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPR89BP0CG08 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPR89BP0CG08 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPR89BP0CG08 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPR89BP0CG08 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPR89BP0CG08 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GPR89BP0CG08 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GPR89BP0CG08 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPR89BP0CG08 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPR89BP0CG08 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPR89BP0CG08 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPR89BP0CG08 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPR89BP0CG08 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPR89BP0CG08 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPR89BP0CG08 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPR89BP0CG08 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPR89BP0CG08 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPR89BP0CG08 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPR89BP0CG08 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPR89BP0CG08 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPR89BP0CG08 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPR89BP0CG08 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPR89BP0CG08 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPR89BP0CG08 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPR89BP0CG08 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPR89BP0CG08 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPR89BP0CG08 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GPR89BP0CG08 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPR89BP0CG08 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPR89BP0CG08 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPR89BP0CG08 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPR89BP0CG08 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPR89BP0CG08 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPR89BP0CG08 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPR89BP0CG08 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GPR89BP0CG08 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPR89BP0CG08 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GPR89BP0CG08 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPR89BP0CG08 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPR89BP0CG08 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPR89BP0CG08 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPR89BP0CG08 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPR89BP0CG08 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPR89BP0CG08 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GPR89BP0CG08 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GPR89BP0CG08 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPR89BP0CG08 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPR89BP0CG08 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPR89BP0CG08 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPR89BP0CG08 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPR89BP0CG08 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPR89BP0CG08 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPR89BP0CG08 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPR89BP0CG08 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPR89BP0CG08 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPR89BP0CG08 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPR89BP0CG08 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPR89BP0CG08 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPR89BP0CG08 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms