Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC172P0C7W6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC172P0C7W6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC172P0C7W6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC172P0C7W6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC172P0C7W6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC172P0C7W6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC172P0C7W6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC172P0C7W6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC172P0C7W6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC172P0C7W6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC172P0C7W6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC172P0C7W6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC172P0C7W6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC172P0C7W6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC172P0C7W6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC172P0C7W6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC172P0C7W6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC172P0C7W6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC172P0C7W6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC172P0C7W6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC172P0C7W6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC172P0C7W6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC172P0C7W6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC172P0C7W6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC172P0C7W6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC172P0C7W6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC172P0C7W6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC172P0C7W6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC172P0C7W6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC172P0C7W6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC172P0C7W6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC172P0C7W6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC172P0C7W6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC172P0C7W6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC172P0C7W6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC172P0C7W6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CCDC172P0C7W6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CCDC172P0C7W6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CCDC172P0C7W6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC172P0C7W6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC172P0C7W6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC172P0C7W6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC172P0C7W6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC172P0C7W6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC172P0C7W6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC172P0C7W6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC172P0C7W6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC172P0C7W6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC172P0C7W6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC172P0C7W6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC172P0C7W6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC172P0C7W6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC172P0C7W6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC172P0C7W6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC172P0C7W6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC172P0C7W6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC172P0C7W6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC172P0C7W6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC172P0C7W6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC172P0C7W6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC172P0C7W6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC172P0C7W6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC172P0C7W6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC172P0C7W6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC172P0C7W6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC172P0C7W6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC172P0C7W6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC172P0C7W6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC172P0C7W6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC172P0C7W6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC172P0C7W6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC172P0C7W6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC172P0C7W6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC172P0C7W6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC172P0C7W6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC172P0C7W6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC172P0C7W6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC172P0C7W6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC172P0C7W6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC172P0C7W6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC172P0C7W6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC172P0C7W6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC172P0C7W6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC172P0C7W6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC172P0C7W6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC172P0C7W6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC172P0C7W6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC172P0C7W6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC172P0C7W6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC172P0C7W6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC172P0C7W6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC172P0C7W6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC172P0C7W6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC172P0C7W6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC172P0C7W6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC172P0C7W6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC172P0C7W6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC172P0C7W6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC172P0C7W6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.9 ms