Protein–RNA interactions for Protein: P0C6S8

LINGO3, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO3P0C6S8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINGO3P0C6S8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINGO3P0C6S8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINGO3P0C6S8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LINGO3P0C6S8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LINGO3P0C6S8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINGO3P0C6S8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINGO3P0C6S8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINGO3P0C6S8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINGO3P0C6S8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINGO3P0C6S8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINGO3P0C6S8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINGO3P0C6S8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINGO3P0C6S8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINGO3P0C6S8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINGO3P0C6S8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINGO3P0C6S8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINGO3P0C6S8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINGO3P0C6S8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINGO3P0C6S8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINGO3P0C6S8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINGO3P0C6S8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINGO3P0C6S8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINGO3P0C6S8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINGO3P0C6S8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINGO3P0C6S8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINGO3P0C6S8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LINGO3P0C6S8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINGO3P0C6S8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINGO3P0C6S8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINGO3P0C6S8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINGO3P0C6S8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINGO3P0C6S8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINGO3P0C6S8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINGO3P0C6S8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINGO3P0C6S8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINGO3P0C6S8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINGO3P0C6S8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINGO3P0C6S8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINGO3P0C6S8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINGO3P0C6S8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LINGO3P0C6S8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINGO3P0C6S8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LINGO3P0C6S8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINGO3P0C6S8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINGO3P0C6S8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINGO3P0C6S8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINGO3P0C6S8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINGO3P0C6S8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINGO3P0C6S8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINGO3P0C6S8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINGO3P0C6S8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINGO3P0C6S8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINGO3P0C6S8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINGO3P0C6S8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINGO3P0C6S8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINGO3P0C6S8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LINGO3P0C6S8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINGO3P0C6S8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINGO3P0C6S8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINGO3P0C6S8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINGO3P0C6S8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINGO3P0C6S8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINGO3P0C6S8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINGO3P0C6S8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINGO3P0C6S8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINGO3P0C6S8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINGO3P0C6S8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINGO3P0C6S8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINGO3P0C6S8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINGO3P0C6S8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINGO3P0C6S8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINGO3P0C6S8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINGO3P0C6S8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINGO3P0C6S8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINGO3P0C6S8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINGO3P0C6S8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINGO3P0C6S8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINGO3P0C6S8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINGO3P0C6S8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINGO3P0C6S8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINGO3P0C6S8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINGO3P0C6S8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LINGO3P0C6S8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LINGO3P0C6S8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINGO3P0C6S8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINGO3P0C6S8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINGO3P0C6S8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINGO3P0C6S8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINGO3P0C6S8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINGO3P0C6S8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINGO3P0C6S8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINGO3P0C6S8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LINGO3P0C6S8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINGO3P0C6S8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINGO3P0C6S8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINGO3P0C6S8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINGO3P0C6S8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINGO3P0C6S8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINGO3P0C6S8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms