Protein–RNA interactions for Protein: P09874

PARP1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP1P09874 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PARP1P09874 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PARP1P09874 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PARP1P09874 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PARP1P09874 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PARP1P09874 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PARP1P09874 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PARP1P09874 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PARP1P09874 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PARP1P09874 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PARP1P09874 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PARP1P09874 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PARP1P09874 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PARP1P09874 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PARP1P09874 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PARP1P09874 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PARP1P09874 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.16
PARP1P09874 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PARP1P09874 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PARP1P09874 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PARP1P09874 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PARP1P09874 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PARP1P09874 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PARP1P09874 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PARP1P09874 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PARP1P09874 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PARP1P09874 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PARP1P09874 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PARP1P09874 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PARP1P09874 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PARP1P09874 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PARP1P09874 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PARP1P09874 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PARP1P09874 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PARP1P09874 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PARP1P09874 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PARP1P09874 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PARP1P09874 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PARP1P09874 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PARP1P09874 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PARP1P09874 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PARP1P09874 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PARP1P09874 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PARP1P09874 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PARP1P09874 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PARP1P09874 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PARP1P09874 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PARP1P09874 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.16
PARP1P09874 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PARP1P09874 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PARP1P09874 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PARP1P09874 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PARP1P09874 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PARP1P09874 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PARP1P09874 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PARP1P09874 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PARP1P09874 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PARP1P09874 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PARP1P09874 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PARP1P09874 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PARP1P09874 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PARP1P09874 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PARP1P09874 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PARP1P09874 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PARP1P09874 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PARP1P09874 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PARP1P09874 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PARP1P09874 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PARP1P09874 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PARP1P09874 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PARP1P09874 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PARP1P09874 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PARP1P09874 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PARP1P09874 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PARP1P09874 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PARP1P09874 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PARP1P09874 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PARP1P09874 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PARP1P09874 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PARP1P09874 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PARP1P09874 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PARP1P09874 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PARP1P09874 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PARP1P09874 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PARP1P09874 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PARP1P09874 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PARP1P09874 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PARP1P09874 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PARP1P09874 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PARP1P09874 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PARP1P09874 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PARP1P09874 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PARP1P09874 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PARP1P09874 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PARP1P09874 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PARP1P09874 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PARP1P09874 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PARP1P09874 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PARP1P09874 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PARP1P09874 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.9 ms