Protein–RNA interactions for Protein: P04000

OPN1LW, Long-wave-sensitive opsin 1, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN1LWP04000 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OPN1LWP04000 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OPN1LWP04000 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OPN1LWP04000 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OPN1LWP04000 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OPN1LWP04000 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
OPN1LWP04000 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OPN1LWP04000 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
OPN1LWP04000 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
OPN1LWP04000 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OPN1LWP04000 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OPN1LWP04000 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OPN1LWP04000 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OPN1LWP04000 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OPN1LWP04000 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OPN1LWP04000 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OPN1LWP04000 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
OPN1LWP04000 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OPN1LWP04000 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
OPN1LWP04000 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OPN1LWP04000 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OPN1LWP04000 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OPN1LWP04000 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OPN1LWP04000 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OPN1LWP04000 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OPN1LWP04000 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OPN1LWP04000 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OPN1LWP04000 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OPN1LWP04000 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OPN1LWP04000 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OPN1LWP04000 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
OPN1LWP04000 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OPN1LWP04000 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
OPN1LWP04000 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OPN1LWP04000 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OPN1LWP04000 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OPN1LWP04000 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OPN1LWP04000 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OPN1LWP04000 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OPN1LWP04000 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
OPN1LWP04000 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OPN1LWP04000 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OPN1LWP04000 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OPN1LWP04000 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OPN1LWP04000 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
OPN1LWP04000 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OPN1LWP04000 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OPN1LWP04000 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OPN1LWP04000 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OPN1LWP04000 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OPN1LWP04000 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OPN1LWP04000 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OPN1LWP04000 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OPN1LWP04000 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OPN1LWP04000 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OPN1LWP04000 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OPN1LWP04000 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OPN1LWP04000 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OPN1LWP04000 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OPN1LWP04000 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OPN1LWP04000 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OPN1LWP04000 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OPN1LWP04000 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
OPN1LWP04000 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OPN1LWP04000 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OPN1LWP04000 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OPN1LWP04000 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OPN1LWP04000 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OPN1LWP04000 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OPN1LWP04000 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
OPN1LWP04000 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OPN1LWP04000 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OPN1LWP04000 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OPN1LWP04000 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OPN1LWP04000 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OPN1LWP04000 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OPN1LWP04000 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
OPN1LWP04000 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OPN1LWP04000 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OPN1LWP04000 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OPN1LWP04000 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OPN1LWP04000 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OPN1LWP04000 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OPN1LWP04000 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OPN1LWP04000 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OPN1LWP04000 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OPN1LWP04000 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OPN1LWP04000 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OPN1LWP04000 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OPN1LWP04000 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OPN1LWP04000 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OPN1LWP04000 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OPN1LWP04000 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OPN1LWP04000 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OPN1LWP04000 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OPN1LWP04000 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OPN1LWP04000 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OPN1LWP04000 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OPN1LWP04000 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OPN1LWP04000 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms