Protein–RNA interactions for Protein: P03886

MT-ND1, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-ND1P03886 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MT-ND1P03886 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MT-ND1P03886 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MT-ND1P03886 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MT-ND1P03886 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MT-ND1P03886 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MT-ND1P03886 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MT-ND1P03886 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MT-ND1P03886 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MT-ND1P03886 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MT-ND1P03886 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MT-ND1P03886 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MT-ND1P03886 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
MT-ND1P03886 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
MT-ND1P03886 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MT-ND1P03886 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MT-ND1P03886 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MT-ND1P03886 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MT-ND1P03886 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MT-ND1P03886 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MT-ND1P03886 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MT-ND1P03886 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MT-ND1P03886 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MT-ND1P03886 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MT-ND1P03886 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MT-ND1P03886 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MT-ND1P03886 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MT-ND1P03886 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MT-ND1P03886 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MT-ND1P03886 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MT-ND1P03886 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MT-ND1P03886 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MT-ND1P03886 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MT-ND1P03886 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MT-ND1P03886 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MT-ND1P03886 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MT-ND1P03886 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MT-ND1P03886 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MT-ND1P03886 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MT-ND1P03886 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MT-ND1P03886 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MT-ND1P03886 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MT-ND1P03886 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MT-ND1P03886 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MT-ND1P03886 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MT-ND1P03886 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MT-ND1P03886 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MT-ND1P03886 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MT-ND1P03886 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MT-ND1P03886 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MT-ND1P03886 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MT-ND1P03886 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MT-ND1P03886 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MT-ND1P03886 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MT-ND1P03886 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MT-ND1P03886 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MT-ND1P03886 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MT-ND1P03886 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MT-ND1P03886 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MT-ND1P03886 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MT-ND1P03886 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MT-ND1P03886 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MT-ND1P03886 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MT-ND1P03886 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MT-ND1P03886 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MT-ND1P03886 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MT-ND1P03886 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MT-ND1P03886 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MT-ND1P03886 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MT-ND1P03886 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MT-ND1P03886 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MT-ND1P03886 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MT-ND1P03886 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MT-ND1P03886 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MT-ND1P03886 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MT-ND1P03886 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MT-ND1P03886 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MT-ND1P03886 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MT-ND1P03886 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MT-ND1P03886 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MT-ND1P03886 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MT-ND1P03886 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MT-ND1P03886 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MT-ND1P03886 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MT-ND1P03886 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MT-ND1P03886 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MT-ND1P03886 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MT-ND1P03886 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MT-ND1P03886 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MT-ND1P03886 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MT-ND1P03886 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MT-ND1P03886 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MT-ND1P03886 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MT-ND1P03886 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MT-ND1P03886 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MT-ND1P03886 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MT-ND1P03886 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MT-ND1P03886 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MT-ND1P03886 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MT-ND1P03886 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms