Protein–RNA interactions for Protein: P01891

HLA-A, HLA class I histocompatibility antigen, A-68 alpha chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-AP01891 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HLA-AP01891 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HLA-AP01891 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HLA-AP01891 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HLA-AP01891 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HLA-AP01891 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HLA-AP01891 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HLA-AP01891 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HLA-AP01891 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HLA-AP01891 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HLA-AP01891 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HLA-AP01891 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HLA-AP01891 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HLA-AP01891 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HLA-AP01891 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HLA-AP01891 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HLA-AP01891 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HLA-AP01891 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HLA-AP01891 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-AP01891 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-AP01891 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-AP01891 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-AP01891 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-AP01891 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-AP01891 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-AP01891 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-AP01891 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-AP01891 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-AP01891 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-AP01891 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-AP01891 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-AP01891 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-AP01891 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-AP01891 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-AP01891 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-AP01891 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-AP01891 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-AP01891 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-AP01891 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-AP01891 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-AP01891 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-AP01891 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-AP01891 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-AP01891 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-AP01891 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-AP01891 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-AP01891 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-AP01891 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-AP01891 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-AP01891 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-AP01891 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-AP01891 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-AP01891 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-AP01891 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-AP01891 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-AP01891 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-AP01891 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-AP01891 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-AP01891 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HLA-AP01891 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HLA-AP01891 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HLA-AP01891 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HLA-AP01891 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HLA-AP01891 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HLA-AP01891 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HLA-AP01891 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HLA-AP01891 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HLA-AP01891 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HLA-AP01891 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HLA-AP01891 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLA-AP01891 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLA-AP01891 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLA-AP01891 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HLA-AP01891 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLA-AP01891 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLA-AP01891 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLA-AP01891 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HLA-AP01891 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLA-AP01891 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLA-AP01891 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLA-AP01891 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLA-AP01891 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLA-AP01891 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLA-AP01891 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLA-AP01891 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLA-AP01891 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLA-AP01891 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HLA-AP01891 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLA-AP01891 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLA-AP01891 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HLA-AP01891 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HLA-AP01891 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HLA-AP01891 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HLA-AP01891 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HLA-AP01891 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HLA-AP01891 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HLA-AP01891 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HLA-AP01891 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HLA-AP01891 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HLA-AP01891 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms