Protein–RNA interactions for Protein: P01282

VIP, VIP peptides, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIPP01282 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VIPP01282 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VIPP01282 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
VIPP01282 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VIPP01282 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VIPP01282 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VIPP01282 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
VIPP01282 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
VIPP01282 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VIPP01282 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VIPP01282 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VIPP01282 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VIPP01282 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
VIPP01282 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VIPP01282 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VIPP01282 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
VIPP01282 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VIPP01282 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VIPP01282 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VIPP01282 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
VIPP01282 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VIPP01282 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
VIPP01282 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VIPP01282 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VIPP01282 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VIPP01282 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VIPP01282 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
VIPP01282 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VIPP01282 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VIPP01282 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VIPP01282 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VIPP01282 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
VIPP01282 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VIPP01282 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VIPP01282 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VIPP01282 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VIPP01282 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
VIPP01282 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VIPP01282 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VIPP01282 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VIPP01282 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VIPP01282 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VIPP01282 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VIPP01282 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VIPP01282 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VIPP01282 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
VIPP01282 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VIPP01282 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
VIPP01282 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
VIPP01282 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VIPP01282 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VIPP01282 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VIPP01282 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VIPP01282 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VIPP01282 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VIPP01282 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VIPP01282 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
VIPP01282 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VIPP01282 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VIPP01282 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VIPP01282 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
VIPP01282 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VIPP01282 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VIPP01282 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VIPP01282 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VIPP01282 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
VIPP01282 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VIPP01282 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VIPP01282 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VIPP01282 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VIPP01282 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VIPP01282 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VIPP01282 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VIPP01282 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VIPP01282 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VIPP01282 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VIPP01282 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VIPP01282 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VIPP01282 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
VIPP01282 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VIPP01282 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VIPP01282 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
VIPP01282 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VIPP01282 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VIPP01282 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VIPP01282 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VIPP01282 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VIPP01282 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VIPP01282 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VIPP01282 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VIPP01282 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VIPP01282 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VIPP01282 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VIPP01282 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
VIPP01282 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VIPP01282 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VIPP01282 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VIPP01282 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VIPP01282 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VIPP01282 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms