Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SEC24BO95487 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SEC24BO95487 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SEC24BO95487 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SEC24BO95487 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SEC24BO95487 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SEC24BO95487 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SEC24BO95487 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SEC24BO95487 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SEC24BO95487 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SEC24BO95487 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SEC24BO95487 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SEC24BO95487 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
SEC24BO95487 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SEC24BO95487 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SEC24BO95487 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SEC24BO95487 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SEC24BO95487 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SEC24BO95487 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SEC24BO95487 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SEC24BO95487 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
SEC24BO95487 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SEC24BO95487 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SEC24BO95487 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SEC24BO95487 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SEC24BO95487 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SEC24BO95487 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SEC24BO95487 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SEC24BO95487 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SEC24BO95487 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SEC24BO95487 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SEC24BO95487 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SEC24BO95487 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SEC24BO95487 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SEC24BO95487 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SEC24BO95487 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SEC24BO95487 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SEC24BO95487 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SEC24BO95487 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SEC24BO95487 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SEC24BO95487 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SEC24BO95487 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SEC24BO95487 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SEC24BO95487 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SEC24BO95487 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SEC24BO95487 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SEC24BO95487 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SEC24BO95487 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SEC24BO95487 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SEC24BO95487 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SEC24BO95487 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SEC24BO95487 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SEC24BO95487 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SEC24BO95487 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SEC24BO95487 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SEC24BO95487 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SEC24BO95487 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
SEC24BO95487 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SEC24BO95487 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SEC24BO95487 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SEC24BO95487 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SEC24BO95487 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SEC24BO95487 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SEC24BO95487 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SEC24BO95487 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SEC24BO95487 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SEC24BO95487 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SEC24BO95487 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SEC24BO95487 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SEC24BO95487 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SEC24BO95487 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SEC24BO95487 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SEC24BO95487 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SEC24BO95487 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SEC24BO95487 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SEC24BO95487 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SEC24BO95487 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SEC24BO95487 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SEC24BO95487 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SEC24BO95487 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SEC24BO95487 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SEC24BO95487 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SEC24BO95487 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SEC24BO95487 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SEC24BO95487 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
SEC24BO95487 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SEC24BO95487 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SEC24BO95487 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SEC24BO95487 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SEC24BO95487 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SEC24BO95487 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SEC24BO95487 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SEC24BO95487 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
SEC24BO95487 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SEC24BO95487 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SEC24BO95487 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SEC24BO95487 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SEC24BO95487 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
SEC24BO95487 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SEC24BO95487 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms