Protein–RNA interactions for Protein: O94779

CNTN5, Contactin-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN5O94779 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTN5O94779 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTN5O94779 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTN5O94779 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTN5O94779 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTN5O94779 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTN5O94779 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTN5O94779 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTN5O94779 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTN5O94779 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTN5O94779 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTN5O94779 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTN5O94779 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTN5O94779 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTN5O94779 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTN5O94779 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTN5O94779 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTN5O94779 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTN5O94779 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTN5O94779 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTN5O94779 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTN5O94779 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTN5O94779 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTN5O94779 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTN5O94779 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTN5O94779 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTN5O94779 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTN5O94779 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTN5O94779 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTN5O94779 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTN5O94779 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTN5O94779 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTN5O94779 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTN5O94779 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTN5O94779 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTN5O94779 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTN5O94779 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTN5O94779 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTN5O94779 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTN5O94779 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTN5O94779 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTN5O94779 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTN5O94779 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTN5O94779 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTN5O94779 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTN5O94779 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTN5O94779 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTN5O94779 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTN5O94779 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTN5O94779 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTN5O94779 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTN5O94779 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTN5O94779 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTN5O94779 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTN5O94779 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTN5O94779 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTN5O94779 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTN5O94779 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTN5O94779 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTN5O94779 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTN5O94779 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTN5O94779 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTN5O94779 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTN5O94779 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTN5O94779 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTN5O94779 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTN5O94779 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTN5O94779 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTN5O94779 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTN5O94779 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTN5O94779 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTN5O94779 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTN5O94779 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTN5O94779 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTN5O94779 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTN5O94779 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTN5O94779 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTN5O94779 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTN5O94779 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTN5O94779 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTN5O94779 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTN5O94779 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTN5O94779 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTN5O94779 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTN5O94779 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTN5O94779 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTN5O94779 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTN5O94779 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTN5O94779 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTN5O94779 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTN5O94779 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTN5O94779 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTN5O94779 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTN5O94779 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTN5O94779 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNTN5O94779 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNTN5O94779 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTN5O94779 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTN5O94779 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTN5O94779 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms