Protein–RNA interactions for Protein: O75871

CEACAM4, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 4, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM4O75871 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEACAM4O75871 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEACAM4O75871 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEACAM4O75871 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEACAM4O75871 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEACAM4O75871 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEACAM4O75871 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEACAM4O75871 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEACAM4O75871 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEACAM4O75871 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEACAM4O75871 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEACAM4O75871 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEACAM4O75871 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEACAM4O75871 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEACAM4O75871 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEACAM4O75871 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEACAM4O75871 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEACAM4O75871 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CEACAM4O75871 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEACAM4O75871 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEACAM4O75871 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEACAM4O75871 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEACAM4O75871 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEACAM4O75871 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEACAM4O75871 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEACAM4O75871 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEACAM4O75871 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEACAM4O75871 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CEACAM4O75871 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CEACAM4O75871 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CEACAM4O75871 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEACAM4O75871 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEACAM4O75871 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CEACAM4O75871 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEACAM4O75871 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CEACAM4O75871 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CEACAM4O75871 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CEACAM4O75871 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CEACAM4O75871 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CEACAM4O75871 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CEACAM4O75871 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CEACAM4O75871 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CEACAM4O75871 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CEACAM4O75871 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CEACAM4O75871 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEACAM4O75871 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEACAM4O75871 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CEACAM4O75871 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CEACAM4O75871 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CEACAM4O75871 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEACAM4O75871 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEACAM4O75871 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEACAM4O75871 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEACAM4O75871 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CEACAM4O75871 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CEACAM4O75871 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CEACAM4O75871 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CEACAM4O75871 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CEACAM4O75871 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CEACAM4O75871 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CEACAM4O75871 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEACAM4O75871 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEACAM4O75871 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEACAM4O75871 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEACAM4O75871 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CEACAM4O75871 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEACAM4O75871 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEACAM4O75871 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEACAM4O75871 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEACAM4O75871 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEACAM4O75871 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEACAM4O75871 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEACAM4O75871 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEACAM4O75871 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEACAM4O75871 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CEACAM4O75871 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEACAM4O75871 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEACAM4O75871 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEACAM4O75871 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEACAM4O75871 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEACAM4O75871 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEACAM4O75871 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEACAM4O75871 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEACAM4O75871 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEACAM4O75871 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEACAM4O75871 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEACAM4O75871 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEACAM4O75871 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEACAM4O75871 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEACAM4O75871 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEACAM4O75871 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEACAM4O75871 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEACAM4O75871 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEACAM4O75871 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEACAM4O75871 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEACAM4O75871 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEACAM4O75871 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEACAM4O75871 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEACAM4O75871 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEACAM4O75871 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms