Protein–RNA interactions for Protein: O75473

LGR5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR5O75473 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LGR5O75473 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LGR5O75473 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
LGR5O75473 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LGR5O75473 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LGR5O75473 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LGR5O75473 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LGR5O75473 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LGR5O75473 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LGR5O75473 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LGR5O75473 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LGR5O75473 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LGR5O75473 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LGR5O75473 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LGR5O75473 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LGR5O75473 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
LGR5O75473 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LGR5O75473 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LGR5O75473 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LGR5O75473 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LGR5O75473 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LGR5O75473 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LGR5O75473 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LGR5O75473 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LGR5O75473 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LGR5O75473 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LGR5O75473 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LGR5O75473 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LGR5O75473 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LGR5O75473 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LGR5O75473 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LGR5O75473 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LGR5O75473 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
LGR5O75473 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LGR5O75473 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LGR5O75473 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
LGR5O75473 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
LGR5O75473 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LGR5O75473 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LGR5O75473 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LGR5O75473 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LGR5O75473 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LGR5O75473 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LGR5O75473 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LGR5O75473 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LGR5O75473 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LGR5O75473 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LGR5O75473 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LGR5O75473 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LGR5O75473 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LGR5O75473 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LGR5O75473 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LGR5O75473 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LGR5O75473 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LGR5O75473 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LGR5O75473 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LGR5O75473 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LGR5O75473 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LGR5O75473 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LGR5O75473 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LGR5O75473 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LGR5O75473 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LGR5O75473 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LGR5O75473 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LGR5O75473 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LGR5O75473 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
LGR5O75473 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LGR5O75473 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LGR5O75473 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LGR5O75473 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LGR5O75473 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LGR5O75473 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LGR5O75473 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LGR5O75473 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LGR5O75473 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LGR5O75473 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LGR5O75473 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LGR5O75473 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LGR5O75473 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LGR5O75473 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
LGR5O75473 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LGR5O75473 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LGR5O75473 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LGR5O75473 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LGR5O75473 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LGR5O75473 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LGR5O75473 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LGR5O75473 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
LGR5O75473 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LGR5O75473 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LGR5O75473 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LGR5O75473 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LGR5O75473 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LGR5O75473 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LGR5O75473 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LGR5O75473 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LGR5O75473 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LGR5O75473 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
LGR5O75473 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
LGR5O75473 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms