Protein–RNA interactions for Protein: O75096

LRP4, Low-density lipoprotein receptor-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP4O75096 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRP4O75096 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRP4O75096 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRP4O75096 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRP4O75096 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRP4O75096 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRP4O75096 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRP4O75096 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRP4O75096 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRP4O75096 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRP4O75096 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRP4O75096 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRP4O75096 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRP4O75096 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRP4O75096 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRP4O75096 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRP4O75096 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRP4O75096 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRP4O75096 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRP4O75096 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRP4O75096 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRP4O75096 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRP4O75096 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRP4O75096 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRP4O75096 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRP4O75096 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRP4O75096 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRP4O75096 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRP4O75096 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRP4O75096 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRP4O75096 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRP4O75096 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRP4O75096 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRP4O75096 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRP4O75096 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRP4O75096 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRP4O75096 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRP4O75096 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRP4O75096 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRP4O75096 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRP4O75096 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRP4O75096 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRP4O75096 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRP4O75096 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRP4O75096 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRP4O75096 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRP4O75096 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRP4O75096 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRP4O75096 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRP4O75096 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRP4O75096 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRP4O75096 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LRP4O75096 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRP4O75096 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRP4O75096 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRP4O75096 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRP4O75096 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRP4O75096 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRP4O75096 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRP4O75096 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRP4O75096 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRP4O75096 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRP4O75096 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRP4O75096 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRP4O75096 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRP4O75096 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRP4O75096 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRP4O75096 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRP4O75096 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRP4O75096 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LRP4O75096 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRP4O75096 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRP4O75096 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRP4O75096 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRP4O75096 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRP4O75096 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRP4O75096 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LRP4O75096 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRP4O75096 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRP4O75096 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRP4O75096 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRP4O75096 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRP4O75096 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRP4O75096 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRP4O75096 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRP4O75096 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRP4O75096 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRP4O75096 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRP4O75096 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRP4O75096 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
LRP4O75096 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LRP4O75096 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRP4O75096 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRP4O75096 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRP4O75096 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRP4O75096 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRP4O75096 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LRP4O75096 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LRP4O75096 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRP4O75096 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms