Protein–RNA interactions for Protein: O60733

PLA2G6, 85/88 kDa calcium-independent phospholipase A2, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLA2G6O60733 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PLA2G6O60733 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PLA2G6O60733 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PLA2G6O60733 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PLA2G6O60733 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PLA2G6O60733 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PLA2G6O60733 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PLA2G6O60733 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PLA2G6O60733 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PLA2G6O60733 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PLA2G6O60733 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PLA2G6O60733 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PLA2G6O60733 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PLA2G6O60733 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PLA2G6O60733 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PLA2G6O60733 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PLA2G6O60733 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PLA2G6O60733 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PLA2G6O60733 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PLA2G6O60733 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PLA2G6O60733 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PLA2G6O60733 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PLA2G6O60733 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PLA2G6O60733 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PLA2G6O60733 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PLA2G6O60733 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PLA2G6O60733 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PLA2G6O60733 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PLA2G6O60733 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PLA2G6O60733 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PLA2G6O60733 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PLA2G6O60733 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PLA2G6O60733 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PLA2G6O60733 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PLA2G6O60733 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PLA2G6O60733 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PLA2G6O60733 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PLA2G6O60733 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PLA2G6O60733 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PLA2G6O60733 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PLA2G6O60733 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PLA2G6O60733 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PLA2G6O60733 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PLA2G6O60733 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PLA2G6O60733 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PLA2G6O60733 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PLA2G6O60733 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PLA2G6O60733 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PLA2G6O60733 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PLA2G6O60733 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PLA2G6O60733 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PLA2G6O60733 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PLA2G6O60733 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PLA2G6O60733 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PLA2G6O60733 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PLA2G6O60733 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PLA2G6O60733 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PLA2G6O60733 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PLA2G6O60733 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PLA2G6O60733 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PLA2G6O60733 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PLA2G6O60733 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PLA2G6O60733 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PLA2G6O60733 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PLA2G6O60733 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PLA2G6O60733 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PLA2G6O60733 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PLA2G6O60733 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PLA2G6O60733 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PLA2G6O60733 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PLA2G6O60733 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PLA2G6O60733 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PLA2G6O60733 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PLA2G6O60733 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PLA2G6O60733 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PLA2G6O60733 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PLA2G6O60733 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PLA2G6O60733 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PLA2G6O60733 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PLA2G6O60733 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PLA2G6O60733 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PLA2G6O60733 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PLA2G6O60733 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PLA2G6O60733 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PLA2G6O60733 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PLA2G6O60733 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PLA2G6O60733 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PLA2G6O60733 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PLA2G6O60733 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PLA2G6O60733 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PLA2G6O60733 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PLA2G6O60733 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PLA2G6O60733 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PLA2G6O60733 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PLA2G6O60733 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PLA2G6O60733 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PLA2G6O60733 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PLA2G6O60733 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PLA2G6O60733 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PLA2G6O60733 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms