Protein–RNA interactions for Protein: O60613

SELENOF, Selenoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOFO60613 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SELENOFO60613 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SELENOFO60613 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SELENOFO60613 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SELENOFO60613 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
SELENOFO60613 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SELENOFO60613 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SELENOFO60613 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SELENOFO60613 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SELENOFO60613 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SELENOFO60613 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SELENOFO60613 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SELENOFO60613 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SELENOFO60613 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SELENOFO60613 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SELENOFO60613 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SELENOFO60613 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SELENOFO60613 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SELENOFO60613 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SELENOFO60613 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SELENOFO60613 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SELENOFO60613 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SELENOFO60613 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SELENOFO60613 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SELENOFO60613 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SELENOFO60613 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SELENOFO60613 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SELENOFO60613 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SELENOFO60613 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SELENOFO60613 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SELENOFO60613 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SELENOFO60613 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SELENOFO60613 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SELENOFO60613 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SELENOFO60613 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SELENOFO60613 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SELENOFO60613 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SELENOFO60613 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SELENOFO60613 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SELENOFO60613 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SELENOFO60613 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SELENOFO60613 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SELENOFO60613 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SELENOFO60613 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SELENOFO60613 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SELENOFO60613 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SELENOFO60613 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SELENOFO60613 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SELENOFO60613 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SELENOFO60613 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SELENOFO60613 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SELENOFO60613 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SELENOFO60613 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SELENOFO60613 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SELENOFO60613 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SELENOFO60613 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SELENOFO60613 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SELENOFO60613 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SELENOFO60613 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SELENOFO60613 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SELENOFO60613 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SELENOFO60613 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SELENOFO60613 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SELENOFO60613 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SELENOFO60613 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SELENOFO60613 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SELENOFO60613 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SELENOFO60613 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SELENOFO60613 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SELENOFO60613 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SELENOFO60613 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SELENOFO60613 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SELENOFO60613 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SELENOFO60613 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SELENOFO60613 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SELENOFO60613 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SELENOFO60613 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SELENOFO60613 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SELENOFO60613 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SELENOFO60613 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SELENOFO60613 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SELENOFO60613 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SELENOFO60613 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SELENOFO60613 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SELENOFO60613 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SELENOFO60613 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SELENOFO60613 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SELENOFO60613 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SELENOFO60613 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SELENOFO60613 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SELENOFO60613 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SELENOFO60613 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SELENOFO60613 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SELENOFO60613 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SELENOFO60613 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SELENOFO60613 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SELENOFO60613 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SELENOFO60613 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SELENOFO60613 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SELENOFO60613 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms