Protein–RNA interactions for Protein: O60522

TDRD6, Tudor domain-containing protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD6O60522 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TDRD6O60522 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TDRD6O60522 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TDRD6O60522 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TDRD6O60522 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TDRD6O60522 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TDRD6O60522 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TDRD6O60522 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TDRD6O60522 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TDRD6O60522 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TDRD6O60522 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TDRD6O60522 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TDRD6O60522 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TDRD6O60522 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TDRD6O60522 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TDRD6O60522 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TDRD6O60522 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TDRD6O60522 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TDRD6O60522 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TDRD6O60522 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TDRD6O60522 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TDRD6O60522 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TDRD6O60522 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TDRD6O60522 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TDRD6O60522 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TDRD6O60522 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TDRD6O60522 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TDRD6O60522 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TDRD6O60522 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TDRD6O60522 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TDRD6O60522 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TDRD6O60522 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TDRD6O60522 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TDRD6O60522 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TDRD6O60522 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TDRD6O60522 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TDRD6O60522 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TDRD6O60522 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TDRD6O60522 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TDRD6O60522 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TDRD6O60522 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TDRD6O60522 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TDRD6O60522 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TDRD6O60522 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TDRD6O60522 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TDRD6O60522 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TDRD6O60522 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TDRD6O60522 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TDRD6O60522 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TDRD6O60522 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TDRD6O60522 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TDRD6O60522 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TDRD6O60522 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TDRD6O60522 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TDRD6O60522 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TDRD6O60522 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TDRD6O60522 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TDRD6O60522 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TDRD6O60522 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TDRD6O60522 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TDRD6O60522 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TDRD6O60522 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TDRD6O60522 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TDRD6O60522 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TDRD6O60522 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TDRD6O60522 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TDRD6O60522 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TDRD6O60522 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TDRD6O60522 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TDRD6O60522 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TDRD6O60522 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TDRD6O60522 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TDRD6O60522 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TDRD6O60522 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TDRD6O60522 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TDRD6O60522 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TDRD6O60522 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TDRD6O60522 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TDRD6O60522 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TDRD6O60522 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TDRD6O60522 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TDRD6O60522 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TDRD6O60522 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TDRD6O60522 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TDRD6O60522 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TDRD6O60522 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TDRD6O60522 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TDRD6O60522 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TDRD6O60522 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TDRD6O60522 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TDRD6O60522 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TDRD6O60522 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TDRD6O60522 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TDRD6O60522 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TDRD6O60522 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TDRD6O60522 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TDRD6O60522 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TDRD6O60522 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TDRD6O60522 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TDRD6O60522 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms