Protein–RNA interactions for Protein: O60504

SORBS3, Vinexin, humanhuman

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORBS3O60504 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SORBS3O60504 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SORBS3O60504 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SORBS3O60504 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SORBS3O60504 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SORBS3O60504 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SORBS3O60504 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SORBS3O60504 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SORBS3O60504 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SORBS3O60504 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SORBS3O60504 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SORBS3O60504 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SORBS3O60504 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SORBS3O60504 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SORBS3O60504 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SORBS3O60504 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SORBS3O60504 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SORBS3O60504 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SORBS3O60504 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SORBS3O60504 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SORBS3O60504 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SORBS3O60504 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SORBS3O60504 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SORBS3O60504 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SORBS3O60504 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SORBS3O60504 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SORBS3O60504 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SORBS3O60504 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SORBS3O60504 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SORBS3O60504 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SORBS3O60504 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SORBS3O60504 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SORBS3O60504 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SORBS3O60504 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SORBS3O60504 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SORBS3O60504 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SORBS3O60504 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SORBS3O60504 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SORBS3O60504 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SORBS3O60504 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SORBS3O60504 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SORBS3O60504 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SORBS3O60504 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SORBS3O60504 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SORBS3O60504 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SORBS3O60504 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
SORBS3O60504 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SORBS3O60504 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SORBS3O60504 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SORBS3O60504 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SORBS3O60504 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SORBS3O60504 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SORBS3O60504 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SORBS3O60504 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SORBS3O60504 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SORBS3O60504 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SORBS3O60504 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SORBS3O60504 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SORBS3O60504 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SORBS3O60504 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SORBS3O60504 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SORBS3O60504 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SORBS3O60504 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SORBS3O60504 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SORBS3O60504 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SORBS3O60504 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SORBS3O60504 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SORBS3O60504 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SORBS3O60504 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SORBS3O60504 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SORBS3O60504 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SORBS3O60504 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SORBS3O60504 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SORBS3O60504 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SORBS3O60504 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SORBS3O60504 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SORBS3O60504 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SORBS3O60504 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SORBS3O60504 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SORBS3O60504 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SORBS3O60504 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SORBS3O60504 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SORBS3O60504 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SORBS3O60504 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SORBS3O60504 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SORBS3O60504 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SORBS3O60504 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SORBS3O60504 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SORBS3O60504 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SORBS3O60504 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SORBS3O60504 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SORBS3O60504 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SORBS3O60504 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SORBS3O60504 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SORBS3O60504 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SORBS3O60504 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SORBS3O60504 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SORBS3O60504 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SORBS3O60504 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SORBS3O60504 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.9 ms