Protein–RNA interactions for Protein: O60481

ZIC3, Zinc finger protein ZIC 3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC3O60481 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZIC3O60481 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZIC3O60481 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZIC3O60481 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZIC3O60481 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZIC3O60481 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZIC3O60481 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZIC3O60481 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZIC3O60481 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZIC3O60481 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZIC3O60481 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZIC3O60481 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZIC3O60481 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZIC3O60481 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZIC3O60481 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZIC3O60481 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZIC3O60481 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZIC3O60481 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ZIC3O60481 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ZIC3O60481 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZIC3O60481 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZIC3O60481 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ZIC3O60481 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZIC3O60481 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZIC3O60481 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZIC3O60481 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZIC3O60481 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZIC3O60481 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZIC3O60481 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ZIC3O60481 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZIC3O60481 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZIC3O60481 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZIC3O60481 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZIC3O60481 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZIC3O60481 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZIC3O60481 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZIC3O60481 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZIC3O60481 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZIC3O60481 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZIC3O60481 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZIC3O60481 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ZIC3O60481 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ZIC3O60481 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZIC3O60481 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZIC3O60481 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZIC3O60481 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZIC3O60481 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZIC3O60481 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZIC3O60481 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZIC3O60481 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZIC3O60481 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZIC3O60481 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZIC3O60481 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZIC3O60481 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZIC3O60481 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZIC3O60481 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZIC3O60481 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZIC3O60481 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ZIC3O60481 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZIC3O60481 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZIC3O60481 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZIC3O60481 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZIC3O60481 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZIC3O60481 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZIC3O60481 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZIC3O60481 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZIC3O60481 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZIC3O60481 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZIC3O60481 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ZIC3O60481 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZIC3O60481 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZIC3O60481 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZIC3O60481 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZIC3O60481 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZIC3O60481 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZIC3O60481 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZIC3O60481 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZIC3O60481 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZIC3O60481 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZIC3O60481 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZIC3O60481 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZIC3O60481 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZIC3O60481 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZIC3O60481 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZIC3O60481 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZIC3O60481 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZIC3O60481 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ZIC3O60481 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZIC3O60481 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZIC3O60481 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZIC3O60481 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZIC3O60481 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZIC3O60481 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZIC3O60481 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZIC3O60481 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZIC3O60481 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZIC3O60481 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZIC3O60481 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZIC3O60481 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZIC3O60481 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.9 ms