Protein–RNA interactions for Protein: O43731

KDELR3, ER lumen protein-retaining receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3O43731 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDELR3O43731 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDELR3O43731 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDELR3O43731 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDELR3O43731 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDELR3O43731 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDELR3O43731 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDELR3O43731 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDELR3O43731 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDELR3O43731 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDELR3O43731 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDELR3O43731 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDELR3O43731 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDELR3O43731 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDELR3O43731 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
KDELR3O43731 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDELR3O43731 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDELR3O43731 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDELR3O43731 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDELR3O43731 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDELR3O43731 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDELR3O43731 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDELR3O43731 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDELR3O43731 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDELR3O43731 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDELR3O43731 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDELR3O43731 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDELR3O43731 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KDELR3O43731 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDELR3O43731 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDELR3O43731 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDELR3O43731 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KDELR3O43731 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDELR3O43731 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDELR3O43731 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDELR3O43731 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
KDELR3O43731 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KDELR3O43731 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDELR3O43731 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDELR3O43731 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDELR3O43731 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDELR3O43731 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDELR3O43731 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
KDELR3O43731 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDELR3O43731 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDELR3O43731 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDELR3O43731 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDELR3O43731 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KDELR3O43731 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDELR3O43731 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDELR3O43731 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDELR3O43731 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDELR3O43731 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDELR3O43731 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDELR3O43731 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDELR3O43731 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDELR3O43731 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDELR3O43731 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDELR3O43731 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDELR3O43731 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDELR3O43731 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KDELR3O43731 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KDELR3O43731 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDELR3O43731 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDELR3O43731 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDELR3O43731 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDELR3O43731 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDELR3O43731 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDELR3O43731 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDELR3O43731 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDELR3O43731 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDELR3O43731 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDELR3O43731 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDELR3O43731 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
KDELR3O43731 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDELR3O43731 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDELR3O43731 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDELR3O43731 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDELR3O43731 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDELR3O43731 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDELR3O43731 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDELR3O43731 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDELR3O43731 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDELR3O43731 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDELR3O43731 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
KDELR3O43731 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDELR3O43731 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDELR3O43731 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDELR3O43731 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDELR3O43731 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDELR3O43731 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDELR3O43731 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
KDELR3O43731 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDELR3O43731 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KDELR3O43731 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
KDELR3O43731 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KDELR3O43731 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDELR3O43731 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDELR3O43731 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDELR3O43731 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.1 ms