Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRTM2O43300 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRTM2O43300 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRTM2O43300 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRTM2O43300 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRTM2O43300 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRTM2O43300 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRTM2O43300 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRTM2O43300 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRTM2O43300 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRTM2O43300 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRTM2O43300 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRTM2O43300 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRTM2O43300 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRTM2O43300 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRTM2O43300 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRTM2O43300 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRTM2O43300 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRTM2O43300 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRTM2O43300 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRTM2O43300 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRTM2O43300 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRTM2O43300 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRTM2O43300 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRTM2O43300 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRTM2O43300 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRTM2O43300 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRTM2O43300 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRTM2O43300 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRTM2O43300 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRTM2O43300 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRTM2O43300 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRTM2O43300 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRTM2O43300 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRTM2O43300 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRTM2O43300 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRTM2O43300 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRTM2O43300 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRTM2O43300 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRTM2O43300 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRTM2O43300 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRTM2O43300 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRTM2O43300 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRTM2O43300 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRTM2O43300 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRTM2O43300 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRTM2O43300 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRTM2O43300 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRTM2O43300 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRTM2O43300 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRTM2O43300 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRTM2O43300 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRTM2O43300 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRTM2O43300 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRTM2O43300 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRTM2O43300 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRTM2O43300 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRTM2O43300 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRTM2O43300 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRTM2O43300 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRTM2O43300 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRTM2O43300 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRTM2O43300 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRTM2O43300 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRTM2O43300 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRTM2O43300 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRTM2O43300 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRTM2O43300 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRTM2O43300 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRTM2O43300 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRTM2O43300 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRTM2O43300 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRTM2O43300 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRTM2O43300 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRTM2O43300 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRTM2O43300 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRTM2O43300 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRTM2O43300 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRTM2O43300 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRTM2O43300 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRTM2O43300 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRTM2O43300 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRTM2O43300 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRTM2O43300 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRTM2O43300 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRTM2O43300 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRTM2O43300 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRTM2O43300 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRTM2O43300 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRTM2O43300 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRTM2O43300 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRTM2O43300 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRTM2O43300 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRTM2O43300 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRTM2O43300 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRTM2O43300 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRTM2O43300 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRTM2O43300 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRTM2O43300 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRTM2O43300 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 516.5 ms