Protein–RNA interactions for Protein: O43272

PRODH, Proline dehydrogenase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODHO43272 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRODHO43272 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRODHO43272 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRODHO43272 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRODHO43272 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRODHO43272 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRODHO43272 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRODHO43272 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRODHO43272 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRODHO43272 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRODHO43272 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRODHO43272 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRODHO43272 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRODHO43272 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRODHO43272 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRODHO43272 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRODHO43272 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRODHO43272 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRODHO43272 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRODHO43272 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRODHO43272 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRODHO43272 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRODHO43272 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRODHO43272 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRODHO43272 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRODHO43272 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRODHO43272 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRODHO43272 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRODHO43272 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRODHO43272 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRODHO43272 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRODHO43272 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRODHO43272 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRODHO43272 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRODHO43272 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRODHO43272 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRODHO43272 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRODHO43272 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRODHO43272 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRODHO43272 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRODHO43272 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRODHO43272 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRODHO43272 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRODHO43272 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRODHO43272 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRODHO43272 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PRODHO43272 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRODHO43272 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRODHO43272 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRODHO43272 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRODHO43272 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRODHO43272 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRODHO43272 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRODHO43272 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRODHO43272 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PRODHO43272 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRODHO43272 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRODHO43272 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRODHO43272 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRODHO43272 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRODHO43272 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRODHO43272 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRODHO43272 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRODHO43272 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRODHO43272 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRODHO43272 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRODHO43272 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRODHO43272 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRODHO43272 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRODHO43272 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRODHO43272 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRODHO43272 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRODHO43272 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRODHO43272 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRODHO43272 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRODHO43272 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRODHO43272 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRODHO43272 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRODHO43272 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRODHO43272 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRODHO43272 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRODHO43272 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRODHO43272 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRODHO43272 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRODHO43272 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRODHO43272 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRODHO43272 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRODHO43272 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRODHO43272 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRODHO43272 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PRODHO43272 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRODHO43272 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRODHO43272 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRODHO43272 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRODHO43272 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRODHO43272 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRODHO43272 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRODHO43272 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRODHO43272 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PRODHO43272 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms