Protein–RNA interactions for Protein: O43236

SEPT4, Septin-4, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPT4O43236 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SEPT4O43236 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SEPT4O43236 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SEPT4O43236 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SEPT4O43236 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SEPT4O43236 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SEPT4O43236 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SEPT4O43236 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SEPT4O43236 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SEPT4O43236 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SEPT4O43236 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SEPT4O43236 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SEPT4O43236 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SEPT4O43236 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SEPT4O43236 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SEPT4O43236 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SEPT4O43236 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SEPT4O43236 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SEPT4O43236 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SEPT4O43236 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SEPT4O43236 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SEPT4O43236 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SEPT4O43236 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SEPT4O43236 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SEPT4O43236 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SEPT4O43236 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SEPT4O43236 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SEPT4O43236 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SEPT4O43236 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SEPT4O43236 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SEPT4O43236 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SEPT4O43236 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SEPT4O43236 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SEPT4O43236 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SEPT4O43236 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SEPT4O43236 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SEPT4O43236 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SEPT4O43236 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SEPT4O43236 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SEPT4O43236 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SEPT4O43236 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SEPT4O43236 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SEPT4O43236 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SEPT4O43236 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SEPT4O43236 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SEPT4O43236 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SEPT4O43236 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SEPT4O43236 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SEPT4O43236 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SEPT4O43236 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SEPT4O43236 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SEPT4O43236 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SEPT4O43236 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SEPT4O43236 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SEPT4O43236 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SEPT4O43236 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SEPT4O43236 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SEPT4O43236 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SEPT4O43236 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SEPT4O43236 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SEPT4O43236 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SEPT4O43236 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SEPT4O43236 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SEPT4O43236 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SEPT4O43236 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SEPT4O43236 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SEPT4O43236 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SEPT4O43236 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SEPT4O43236 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SEPT4O43236 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SEPT4O43236 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SEPT4O43236 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SEPT4O43236 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SEPT4O43236 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SEPT4O43236 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SEPT4O43236 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SEPT4O43236 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SEPT4O43236 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SEPT4O43236 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SEPT4O43236 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SEPT4O43236 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SEPT4O43236 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SEPT4O43236 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SEPT4O43236 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SEPT4O43236 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SEPT4O43236 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SEPT4O43236 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SEPT4O43236 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SEPT4O43236 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SEPT4O43236 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SEPT4O43236 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SEPT4O43236 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SEPT4O43236 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SEPT4O43236 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SEPT4O43236 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SEPT4O43236 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SEPT4O43236 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SEPT4O43236 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SEPT4O43236 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SEPT4O43236 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms