Protein–RNA interactions for Protein: O15260

SURF4, Surfeit locus protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF4O15260 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SURF4O15260 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SURF4O15260 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SURF4O15260 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SURF4O15260 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SURF4O15260 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SURF4O15260 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SURF4O15260 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SURF4O15260 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SURF4O15260 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SURF4O15260 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SURF4O15260 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SURF4O15260 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SURF4O15260 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SURF4O15260 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SURF4O15260 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SURF4O15260 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SURF4O15260 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SURF4O15260 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SURF4O15260 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SURF4O15260 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SURF4O15260 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SURF4O15260 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SURF4O15260 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SURF4O15260 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SURF4O15260 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SURF4O15260 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SURF4O15260 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SURF4O15260 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SURF4O15260 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SURF4O15260 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SURF4O15260 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SURF4O15260 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SURF4O15260 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SURF4O15260 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SURF4O15260 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SURF4O15260 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SURF4O15260 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SURF4O15260 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SURF4O15260 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SURF4O15260 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SURF4O15260 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SURF4O15260 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SURF4O15260 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SURF4O15260 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SURF4O15260 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SURF4O15260 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SURF4O15260 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SURF4O15260 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SURF4O15260 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SURF4O15260 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SURF4O15260 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SURF4O15260 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SURF4O15260 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SURF4O15260 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SURF4O15260 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SURF4O15260 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SURF4O15260 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SURF4O15260 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SURF4O15260 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SURF4O15260 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SURF4O15260 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SURF4O15260 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SURF4O15260 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SURF4O15260 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SURF4O15260 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SURF4O15260 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SURF4O15260 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SURF4O15260 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SURF4O15260 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SURF4O15260 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SURF4O15260 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SURF4O15260 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SURF4O15260 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SURF4O15260 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SURF4O15260 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SURF4O15260 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SURF4O15260 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SURF4O15260 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SURF4O15260 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SURF4O15260 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SURF4O15260 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SURF4O15260 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SURF4O15260 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SURF4O15260 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SURF4O15260 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SURF4O15260 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SURF4O15260 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SURF4O15260 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SURF4O15260 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SURF4O15260 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SURF4O15260 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SURF4O15260 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SURF4O15260 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SURF4O15260 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SURF4O15260 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SURF4O15260 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SURF4O15260 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SURF4O15260 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SURF4O15260 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms