Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
PTPRTO14522 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
PTPRTO14522 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
PTPRTO14522 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
PTPRTO14522 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
PTPRTO14522 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
PTPRTO14522 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
PTPRTO14522 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
PTPRTO14522 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
PTPRTO14522 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.43
PTPRTO14522 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
PTPRTO14522 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
PTPRTO14522 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
PTPRTO14522 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
PTPRTO14522 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
PTPRTO14522 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
PTPRTO14522 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
PTPRTO14522 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
PTPRTO14522 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
PTPRTO14522 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
PTPRTO14522 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
PTPRTO14522 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
PTPRTO14522 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
PTPRTO14522 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
PTPRTO14522 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
PTPRTO14522 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
PTPRTO14522 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
PTPRTO14522 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
PTPRTO14522 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
PTPRTO14522 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
PTPRTO14522 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
PTPRTO14522 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
PTPRTO14522 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.42
PTPRTO14522 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PTPRTO14522 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
PTPRTO14522 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
PTPRTO14522 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
PTPRTO14522 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
PTPRTO14522 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
PTPRTO14522 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
PTPRTO14522 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
PTPRTO14522 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
PTPRTO14522 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
PTPRTO14522 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
PTPRTO14522 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
PTPRTO14522 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
PTPRTO14522 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
PTPRTO14522 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC36.39■■■■□ 3.42
PTPRTO14522 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
PTPRTO14522 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
PTPRTO14522 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
PTPRTO14522 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
PTPRTO14522 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
PTPRTO14522 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
PTPRTO14522 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
PTPRTO14522 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
PTPRTO14522 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
PTPRTO14522 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
PTPRTO14522 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
PTPRTO14522 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
PTPRTO14522 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
PTPRTO14522 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
PTPRTO14522 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
PTPRTO14522 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
PTPRTO14522 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
PTPRTO14522 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
PTPRTO14522 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
PTPRTO14522 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
PTPRTO14522 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
PTPRTO14522 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
PTPRTO14522 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
PTPRTO14522 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
PTPRTO14522 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
PTPRTO14522 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC36.33■■■■□ 3.41
PTPRTO14522 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
PTPRTO14522 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PTPRTO14522 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PTPRTO14522 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PTPRTO14522 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PTPRTO14522 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PTPRTO14522 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PTPRTO14522 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
PTPRTO14522 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
PTPRTO14522 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
PTPRTO14522 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
PTPRTO14522 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
PTPRTO14522 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
PTPRTO14522 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
PTPRTO14522 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
PTPRTO14522 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
PTPRTO14522 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC36.27■■■■□ 3.4
PTPRTO14522 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC36.27■■■■□ 3.4
PTPRTO14522 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
PTPRTO14522 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
PTPRTO14522 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
PTPRTO14522 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
PTPRTO14522 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
PTPRTO14522 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
PTPRTO14522 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
PTPRTO14522 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms