Protein–RNA interactions for Protein: O00634

NTN3, Netrin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTN3O00634 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NTN3O00634 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NTN3O00634 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NTN3O00634 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NTN3O00634 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NTN3O00634 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NTN3O00634 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NTN3O00634 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NTN3O00634 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NTN3O00634 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NTN3O00634 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NTN3O00634 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NTN3O00634 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NTN3O00634 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NTN3O00634 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NTN3O00634 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NTN3O00634 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NTN3O00634 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NTN3O00634 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NTN3O00634 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NTN3O00634 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NTN3O00634 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NTN3O00634 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NTN3O00634 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NTN3O00634 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NTN3O00634 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NTN3O00634 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NTN3O00634 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NTN3O00634 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NTN3O00634 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NTN3O00634 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NTN3O00634 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NTN3O00634 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NTN3O00634 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NTN3O00634 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NTN3O00634 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NTN3O00634 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NTN3O00634 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NTN3O00634 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NTN3O00634 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NTN3O00634 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NTN3O00634 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NTN3O00634 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NTN3O00634 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NTN3O00634 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NTN3O00634 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NTN3O00634 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NTN3O00634 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NTN3O00634 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NTN3O00634 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NTN3O00634 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NTN3O00634 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NTN3O00634 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NTN3O00634 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NTN3O00634 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NTN3O00634 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NTN3O00634 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NTN3O00634 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NTN3O00634 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NTN3O00634 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NTN3O00634 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NTN3O00634 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NTN3O00634 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NTN3O00634 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NTN3O00634 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NTN3O00634 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NTN3O00634 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NTN3O00634 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NTN3O00634 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NTN3O00634 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NTN3O00634 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NTN3O00634 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NTN3O00634 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NTN3O00634 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NTN3O00634 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NTN3O00634 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NTN3O00634 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NTN3O00634 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NTN3O00634 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NTN3O00634 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NTN3O00634 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NTN3O00634 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NTN3O00634 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NTN3O00634 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NTN3O00634 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NTN3O00634 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NTN3O00634 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NTN3O00634 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NTN3O00634 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NTN3O00634 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NTN3O00634 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NTN3O00634 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NTN3O00634 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NTN3O00634 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NTN3O00634 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NTN3O00634 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NTN3O00634 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NTN3O00634 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NTN3O00634 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NTN3O00634 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms