Protein–RNA interactions for Protein: O00567

NOP56, Nucleolar protein 56, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56O00567 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NOP56O00567 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NOP56O00567 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NOP56O00567 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
NOP56O00567 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NOP56O00567 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NOP56O00567 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NOP56O00567 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NOP56O00567 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NOP56O00567 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NOP56O00567 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NOP56O00567 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NOP56O00567 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NOP56O00567 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NOP56O00567 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NOP56O00567 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NOP56O00567 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NOP56O00567 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NOP56O00567 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NOP56O00567 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NOP56O00567 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NOP56O00567 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NOP56O00567 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NOP56O00567 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NOP56O00567 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NOP56O00567 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NOP56O00567 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NOP56O00567 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NOP56O00567 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NOP56O00567 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NOP56O00567 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NOP56O00567 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NOP56O00567 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NOP56O00567 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NOP56O00567 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.58■■■□□ 2
NOP56O00567 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NOP56O00567 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
NOP56O00567 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NOP56O00567 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.56■■■□□ 2
NOP56O00567 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NOP56O00567 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NOP56O00567 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NOP56O00567 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NOP56O00567 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
NOP56O00567 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NOP56O00567 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NOP56O00567 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NOP56O00567 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NOP56O00567 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NOP56O00567 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NOP56O00567 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NOP56O00567 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NOP56O00567 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NOP56O00567 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NOP56O00567 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NOP56O00567 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NOP56O00567 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NOP56O00567 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NOP56O00567 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NOP56O00567 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NOP56O00567 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NOP56O00567 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NOP56O00567 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NOP56O00567 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.51■■■□□ 2
NOP56O00567 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NOP56O00567 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NOP56O00567 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NOP56O00567 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NOP56O00567 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NOP56O00567 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NOP56O00567 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NOP56O00567 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NOP56O00567 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NOP56O00567 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NOP56O00567 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NOP56O00567 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NOP56O00567 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NOP56O00567 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NOP56O00567 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NOP56O00567 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NOP56O00567 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NOP56O00567 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NOP56O00567 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NOP56O00567 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NOP56O00567 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NOP56O00567 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NOP56O00567 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NOP56O00567 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NOP56O00567 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NOP56O00567 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NOP56O00567 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NOP56O00567 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NOP56O00567 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NOP56O00567 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NOP56O00567 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NOP56O00567 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NOP56O00567 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NOP56O00567 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NOP56O00567 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NOP56O00567 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms