Protein–RNA interactions for Protein: O00116

AGPS, Alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, peroxisomal, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPSO00116 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGPSO00116 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGPSO00116 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGPSO00116 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AGPSO00116 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AGPSO00116 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AGPSO00116 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
AGPSO00116 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AGPSO00116 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AGPSO00116 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AGPSO00116 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AGPSO00116 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AGPSO00116 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AGPSO00116 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
AGPSO00116 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AGPSO00116 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AGPSO00116 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AGPSO00116 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AGPSO00116 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGPSO00116 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGPSO00116 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGPSO00116 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGPSO00116 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGPSO00116 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGPSO00116 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGPSO00116 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGPSO00116 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGPSO00116 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AGPSO00116 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AGPSO00116 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AGPSO00116 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AGPSO00116 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AGPSO00116 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AGPSO00116 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AGPSO00116 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AGPSO00116 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AGPSO00116 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AGPSO00116 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AGPSO00116 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AGPSO00116 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AGPSO00116 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AGPSO00116 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AGPSO00116 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AGPSO00116 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
AGPSO00116 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AGPSO00116 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AGPSO00116 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AGPSO00116 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AGPSO00116 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
AGPSO00116 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AGPSO00116 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AGPSO00116 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AGPSO00116 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
AGPSO00116 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
AGPSO00116 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AGPSO00116 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AGPSO00116 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AGPSO00116 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AGPSO00116 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
AGPSO00116 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AGPSO00116 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AGPSO00116 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AGPSO00116 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AGPSO00116 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AGPSO00116 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AGPSO00116 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AGPSO00116 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AGPSO00116 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AGPSO00116 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AGPSO00116 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AGPSO00116 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AGPSO00116 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AGPSO00116 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AGPSO00116 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AGPSO00116 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AGPSO00116 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AGPSO00116 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AGPSO00116 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AGPSO00116 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AGPSO00116 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AGPSO00116 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AGPSO00116 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AGPSO00116 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AGPSO00116 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AGPSO00116 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AGPSO00116 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AGPSO00116 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AGPSO00116 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AGPSO00116 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AGPSO00116 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AGPSO00116 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AGPSO00116 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AGPSO00116 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
AGPSO00116 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
AGPSO00116 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
AGPSO00116 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
AGPSO00116 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
AGPSO00116 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
AGPSO00116 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AGPSO00116 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms