Protein–RNA interactions for Protein: J3QRE1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRE1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
J3QRE1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
J3QRE1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
J3QRE1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
J3QRE1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
J3QRE1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
J3QRE1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
J3QRE1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
J3QRE1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
J3QRE1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
J3QRE1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
J3QRE1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
J3QRE1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
J3QRE1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
J3QRE1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
J3QRE1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
J3QRE1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
J3QRE1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
J3QRE1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
J3QRE1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
J3QRE1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
J3QRE1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
J3QRE1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
J3QRE1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
J3QRE1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
J3QRE1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
J3QRE1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
J3QRE1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
J3QRE1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
J3QRE1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
J3QRE1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
J3QRE1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
J3QRE1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
J3QRE1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
J3QRE1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
J3QRE1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
J3QRE1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
J3QRE1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
J3QRE1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
J3QRE1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
J3QRE1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
J3QRE1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
J3QRE1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
J3QRE1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
J3QRE1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
J3QRE1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
J3QRE1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
J3QRE1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
J3QRE1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
J3QRE1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
J3QRE1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
J3QRE1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
J3QRE1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
J3QRE1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
J3QRE1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
J3QRE1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
J3QRE1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
J3QRE1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
J3QRE1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
J3QRE1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
J3QRE1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
J3QRE1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
J3QRE1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
J3QRE1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
J3QRE1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
J3QRE1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
J3QRE1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
J3QRE1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
J3QRE1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
J3QRE1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
J3QRE1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
J3QRE1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
J3QRE1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
J3QRE1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
J3QRE1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
J3QRE1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
J3QRE1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
J3QRE1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
J3QRE1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
J3QRE1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
J3QRE1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
J3QRE1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
J3QRE1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
J3QRE1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
J3QRE1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
J3QRE1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
J3QRE1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
J3QRE1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
J3QRE1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
J3QRE1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
J3QRE1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
J3QRE1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
J3QRE1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
J3QRE1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
J3QRE1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
J3QRE1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
J3QRE1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
J3QRE1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
J3QRE1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
J3QRE1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms