Protein–RNA interactions for Protein: H3BML4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BML4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H3BML4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H3BML4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H3BML4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H3BML4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H3BML4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H3BML4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H3BML4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H3BML4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
H3BML4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
H3BML4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H3BML4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
H3BML4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H3BML4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
H3BML4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H3BML4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H3BML4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
H3BML4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
H3BML4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
H3BML4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
H3BML4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BML4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BML4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BML4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BML4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BML4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BML4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BML4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BML4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
H3BML4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H3BML4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H3BML4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H3BML4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H3BML4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H3BML4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H3BML4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H3BML4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H3BML4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H3BML4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H3BML4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BML4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BML4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BML4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BML4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BML4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BML4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H3BML4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H3BML4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H3BML4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H3BML4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
H3BML4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H3BML4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H3BML4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BML4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BML4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BML4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BML4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BML4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BML4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
H3BML4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H3BML4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H3BML4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
H3BML4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H3BML4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H3BML4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H3BML4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H3BML4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H3BML4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H3BML4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H3BML4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H3BML4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H3BML4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H3BML4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
H3BML4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H3BML4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H3BML4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H3BML4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H3BML4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BML4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BML4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BML4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BML4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BML4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BML4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BML4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BML4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BML4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3BML4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3BML4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3BML4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3BML4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3BML4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3BML4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3BML4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
H3BML4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
H3BML4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
H3BML4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H3BML4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H3BML4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H3BML4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms