Protein–RNA interactions for Protein: F8VUJ3

POC1B-GALNT4, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POC1B-GALNT4F8VUJ3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POC1B-GALNT4F8VUJ3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POC1B-GALNT4F8VUJ3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POC1B-GALNT4F8VUJ3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POC1B-GALNT4F8VUJ3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POC1B-GALNT4F8VUJ3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POC1B-GALNT4F8VUJ3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POC1B-GALNT4F8VUJ3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
POC1B-GALNT4F8VUJ3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POC1B-GALNT4F8VUJ3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POC1B-GALNT4F8VUJ3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
POC1B-GALNT4F8VUJ3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POC1B-GALNT4F8VUJ3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POC1B-GALNT4F8VUJ3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POC1B-GALNT4F8VUJ3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POC1B-GALNT4F8VUJ3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POC1B-GALNT4F8VUJ3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
POC1B-GALNT4F8VUJ3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POC1B-GALNT4F8VUJ3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
POC1B-GALNT4F8VUJ3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POC1B-GALNT4F8VUJ3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms