Protein–RNA interactions for Protein: A8MUH7

PDZK1P1, Putative PDZ domain-containing protein PDZK1P1, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1P1A8MUH7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDZK1P1A8MUH7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDZK1P1A8MUH7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PDZK1P1A8MUH7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDZK1P1A8MUH7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDZK1P1A8MUH7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDZK1P1A8MUH7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDZK1P1A8MUH7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDZK1P1A8MUH7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PDZK1P1A8MUH7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDZK1P1A8MUH7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDZK1P1A8MUH7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDZK1P1A8MUH7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDZK1P1A8MUH7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDZK1P1A8MUH7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDZK1P1A8MUH7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDZK1P1A8MUH7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDZK1P1A8MUH7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZK1P1A8MUH7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZK1P1A8MUH7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZK1P1A8MUH7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZK1P1A8MUH7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZK1P1A8MUH7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZK1P1A8MUH7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZK1P1A8MUH7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZK1P1A8MUH7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZK1P1A8MUH7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZK1P1A8MUH7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZK1P1A8MUH7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZK1P1A8MUH7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZK1P1A8MUH7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZK1P1A8MUH7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZK1P1A8MUH7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZK1P1A8MUH7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZK1P1A8MUH7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZK1P1A8MUH7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZK1P1A8MUH7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZK1P1A8MUH7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZK1P1A8MUH7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZK1P1A8MUH7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZK1P1A8MUH7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZK1P1A8MUH7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZK1P1A8MUH7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZK1P1A8MUH7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZK1P1A8MUH7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZK1P1A8MUH7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZK1P1A8MUH7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDZK1P1A8MUH7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDZK1P1A8MUH7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PDZK1P1A8MUH7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDZK1P1A8MUH7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDZK1P1A8MUH7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZK1P1A8MUH7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZK1P1A8MUH7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZK1P1A8MUH7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZK1P1A8MUH7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZK1P1A8MUH7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZK1P1A8MUH7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.8 ms