Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC39.03■■■■□ 3.84
ARID3CA6NKF2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
ARID3CA6NKF2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
ARID3CA6NKF2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.84
ARID3CA6NKF2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
ARID3CA6NKF2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC39■■■■□ 3.83
ARID3CA6NKF2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC39■■■■□ 3.83
ARID3CA6NKF2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
ARID3CA6NKF2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
ARID3CA6NKF2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC38.99■■■■□ 3.83
ARID3CA6NKF2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
ARID3CA6NKF2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
ARID3CA6NKF2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
ARID3CA6NKF2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
ARID3CA6NKF2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
ARID3CA6NKF2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
ARID3CA6NKF2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
ARID3CA6NKF2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
ARID3CA6NKF2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
ARID3CA6NKF2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
ARID3CA6NKF2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
ARID3CA6NKF2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
ARID3CA6NKF2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
ARID3CA6NKF2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
ARID3CA6NKF2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC38.95■■■■□ 3.83
ARID3CA6NKF2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.95■■■■□ 3.83
ARID3CA6NKF2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
ARID3CA6NKF2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC38.94■■■■□ 3.82
ARID3CA6NKF2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
ARID3CA6NKF2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
ARID3CA6NKF2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
ARID3CA6NKF2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.93■■■■□ 3.82
ARID3CA6NKF2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
ARID3CA6NKF2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC38.93■■■■□ 3.82
ARID3CA6NKF2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
ARID3CA6NKF2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
ARID3CA6NKF2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC38.93■■■■□ 3.82
ARID3CA6NKF2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC38.93■■■■□ 3.82
ARID3CA6NKF2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
ARID3CA6NKF2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
ARID3CA6NKF2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC38.9■■■■□ 3.82
ARID3CA6NKF2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
ARID3CA6NKF2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
ARID3CA6NKF2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
ARID3CA6NKF2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
ARID3CA6NKF2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
ARID3CA6NKF2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
ARID3CA6NKF2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC38.88■■■■□ 3.81
ARID3CA6NKF2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
ARID3CA6NKF2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
ARID3CA6NKF2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
ARID3CA6NKF2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
ARID3CA6NKF2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
ARID3CA6NKF2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
ARID3CA6NKF2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC38.85■■■■□ 3.81
ARID3CA6NKF2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
ARID3CA6NKF2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC38.84■■■■□ 3.81
ARID3CA6NKF2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC38.84■■■■□ 3.81
ARID3CA6NKF2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC38.83■■■■□ 3.81
ARID3CA6NKF2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
ARID3CA6NKF2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
ARID3CA6NKF2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
ARID3CA6NKF2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
ARID3CA6NKF2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC38.82■■■■□ 3.8
ARID3CA6NKF2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.82■■■■□ 3.8
ARID3CA6NKF2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
ARID3CA6NKF2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
ARID3CA6NKF2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
ARID3CA6NKF2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
ARID3CA6NKF2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
ARID3CA6NKF2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
ARID3CA6NKF2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC38.79■■■■□ 3.8
ARID3CA6NKF2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
ARID3CA6NKF2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
ARID3CA6NKF2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
ARID3CA6NKF2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC38.78■■■■□ 3.8
ARID3CA6NKF2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
ARID3CA6NKF2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
ARID3CA6NKF2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
ARID3CA6NKF2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
ARID3CA6NKF2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
ARID3CA6NKF2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
ARID3CA6NKF2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
ARID3CA6NKF2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
ARID3CA6NKF2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC38.75■■■■□ 3.79
ARID3CA6NKF2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC38.75■■■■□ 3.79
ARID3CA6NKF2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC38.75■■■■□ 3.79
ARID3CA6NKF2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
ARID3CA6NKF2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
ARID3CA6NKF2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC38.74■■■■□ 3.79
ARID3CA6NKF2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
ARID3CA6NKF2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
ARID3CA6NKF2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
ARID3CA6NKF2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
ARID3CA6NKF2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
ARID3CA6NKF2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
ARID3CA6NKF2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
ARID3CA6NKF2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
ARID3CA6NKF2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
ARID3CA6NKF2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms