Protein–RNA interactions for Protein: A6NIE6

RRN3P2, Putative RRN3-like protein RRN3P2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P2A6NIE6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RRN3P2A6NIE6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RRN3P2A6NIE6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RRN3P2A6NIE6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RRN3P2A6NIE6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
RRN3P2A6NIE6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RRN3P2A6NIE6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RRN3P2A6NIE6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RRN3P2A6NIE6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RRN3P2A6NIE6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RRN3P2A6NIE6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
RRN3P2A6NIE6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
RRN3P2A6NIE6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RRN3P2A6NIE6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RRN3P2A6NIE6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RRN3P2A6NIE6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRN3P2A6NIE6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRN3P2A6NIE6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRN3P2A6NIE6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRN3P2A6NIE6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
RRN3P2A6NIE6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRN3P2A6NIE6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRN3P2A6NIE6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRN3P2A6NIE6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRN3P2A6NIE6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRN3P2A6NIE6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRN3P2A6NIE6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRN3P2A6NIE6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRN3P2A6NIE6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRN3P2A6NIE6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRN3P2A6NIE6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
RRN3P2A6NIE6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRN3P2A6NIE6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRN3P2A6NIE6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRN3P2A6NIE6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRN3P2A6NIE6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRN3P2A6NIE6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRN3P2A6NIE6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
RRN3P2A6NIE6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRN3P2A6NIE6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRN3P2A6NIE6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRN3P2A6NIE6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
RRN3P2A6NIE6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
RRN3P2A6NIE6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
RRN3P2A6NIE6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RRN3P2A6NIE6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RRN3P2A6NIE6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RRN3P2A6NIE6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RRN3P2A6NIE6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RRN3P2A6NIE6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RRN3P2A6NIE6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RRN3P2A6NIE6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RRN3P2A6NIE6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RRN3P2A6NIE6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RRN3P2A6NIE6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RRN3P2A6NIE6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RRN3P2A6NIE6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RRN3P2A6NIE6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RRN3P2A6NIE6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RRN3P2A6NIE6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RRN3P2A6NIE6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RRN3P2A6NIE6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRN3P2A6NIE6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRN3P2A6NIE6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RRN3P2A6NIE6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RRN3P2A6NIE6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RRN3P2A6NIE6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RRN3P2A6NIE6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RRN3P2A6NIE6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RRN3P2A6NIE6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RRN3P2A6NIE6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RRN3P2A6NIE6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RRN3P2A6NIE6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RRN3P2A6NIE6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RRN3P2A6NIE6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RRN3P2A6NIE6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RRN3P2A6NIE6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RRN3P2A6NIE6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RRN3P2A6NIE6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RRN3P2A6NIE6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RRN3P2A6NIE6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RRN3P2A6NIE6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RRN3P2A6NIE6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RRN3P2A6NIE6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RRN3P2A6NIE6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RRN3P2A6NIE6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RRN3P2A6NIE6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RRN3P2A6NIE6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RRN3P2A6NIE6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RRN3P2A6NIE6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RRN3P2A6NIE6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RRN3P2A6NIE6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RRN3P2A6NIE6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RRN3P2A6NIE6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RRN3P2A6NIE6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRN3P2A6NIE6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRN3P2A6NIE6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRN3P2A6NIE6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRN3P2A6NIE6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRN3P2A6NIE6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms