Protein–RNA interactions for Protein: A6NI87

CBY3, Protein chibby homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBY3A6NI87 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBY3A6NI87 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBY3A6NI87 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBY3A6NI87 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBY3A6NI87 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBY3A6NI87 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBY3A6NI87 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBY3A6NI87 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBY3A6NI87 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBY3A6NI87 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBY3A6NI87 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBY3A6NI87 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBY3A6NI87 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBY3A6NI87 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBY3A6NI87 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBY3A6NI87 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBY3A6NI87 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBY3A6NI87 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBY3A6NI87 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBY3A6NI87 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBY3A6NI87 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBY3A6NI87 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBY3A6NI87 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBY3A6NI87 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBY3A6NI87 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CBY3A6NI87 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CBY3A6NI87 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBY3A6NI87 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBY3A6NI87 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBY3A6NI87 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBY3A6NI87 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBY3A6NI87 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBY3A6NI87 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBY3A6NI87 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBY3A6NI87 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBY3A6NI87 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBY3A6NI87 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBY3A6NI87 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBY3A6NI87 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBY3A6NI87 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBY3A6NI87 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBY3A6NI87 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBY3A6NI87 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBY3A6NI87 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBY3A6NI87 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBY3A6NI87 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBY3A6NI87 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBY3A6NI87 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CBY3A6NI87 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBY3A6NI87 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBY3A6NI87 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBY3A6NI87 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBY3A6NI87 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CBY3A6NI87 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CBY3A6NI87 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CBY3A6NI87 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CBY3A6NI87 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CBY3A6NI87 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CBY3A6NI87 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CBY3A6NI87 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CBY3A6NI87 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBY3A6NI87 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBY3A6NI87 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBY3A6NI87 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBY3A6NI87 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBY3A6NI87 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBY3A6NI87 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBY3A6NI87 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBY3A6NI87 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBY3A6NI87 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBY3A6NI87 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBY3A6NI87 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBY3A6NI87 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBY3A6NI87 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CBY3A6NI87 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CBY3A6NI87 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CBY3A6NI87 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CBY3A6NI87 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CBY3A6NI87 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CBY3A6NI87 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CBY3A6NI87 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CBY3A6NI87 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CBY3A6NI87 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CBY3A6NI87 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CBY3A6NI87 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CBY3A6NI87 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CBY3A6NI87 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CBY3A6NI87 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CBY3A6NI87 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CBY3A6NI87 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CBY3A6NI87 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CBY3A6NI87 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CBY3A6NI87 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CBY3A6NI87 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CBY3A6NI87 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CBY3A6NI87 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CBY3A6NI87 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CBY3A6NI87 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CBY3A6NI87 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CBY3A6NI87 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms