Protein–RNA interactions for Protein: A6NHN0

OTOL1, Otolin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOL1A6NHN0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
OTOL1A6NHN0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
OTOL1A6NHN0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
OTOL1A6NHN0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
OTOL1A6NHN0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
OTOL1A6NHN0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
OTOL1A6NHN0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
OTOL1A6NHN0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
OTOL1A6NHN0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
OTOL1A6NHN0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
OTOL1A6NHN0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
OTOL1A6NHN0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
OTOL1A6NHN0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
OTOL1A6NHN0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
OTOL1A6NHN0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
OTOL1A6NHN0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
OTOL1A6NHN0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
OTOL1A6NHN0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
OTOL1A6NHN0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
OTOL1A6NHN0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
OTOL1A6NHN0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
OTOL1A6NHN0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
OTOL1A6NHN0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
OTOL1A6NHN0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
OTOL1A6NHN0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
OTOL1A6NHN0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
OTOL1A6NHN0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
OTOL1A6NHN0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
OTOL1A6NHN0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
OTOL1A6NHN0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
OTOL1A6NHN0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
OTOL1A6NHN0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
OTOL1A6NHN0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
OTOL1A6NHN0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
OTOL1A6NHN0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
OTOL1A6NHN0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
OTOL1A6NHN0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
OTOL1A6NHN0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
OTOL1A6NHN0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
OTOL1A6NHN0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
OTOL1A6NHN0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
OTOL1A6NHN0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
OTOL1A6NHN0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
OTOL1A6NHN0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
OTOL1A6NHN0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
OTOL1A6NHN0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
OTOL1A6NHN0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
OTOL1A6NHN0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
OTOL1A6NHN0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
OTOL1A6NHN0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
OTOL1A6NHN0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
OTOL1A6NHN0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
OTOL1A6NHN0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
OTOL1A6NHN0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
OTOL1A6NHN0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTOL1A6NHN0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTOL1A6NHN0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTOL1A6NHN0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTOL1A6NHN0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTOL1A6NHN0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTOL1A6NHN0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTOL1A6NHN0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTOL1A6NHN0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTOL1A6NHN0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
OTOL1A6NHN0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
OTOL1A6NHN0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
OTOL1A6NHN0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
OTOL1A6NHN0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
OTOL1A6NHN0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
OTOL1A6NHN0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
OTOL1A6NHN0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
OTOL1A6NHN0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
OTOL1A6NHN0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
OTOL1A6NHN0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
OTOL1A6NHN0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
OTOL1A6NHN0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
OTOL1A6NHN0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
OTOL1A6NHN0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
OTOL1A6NHN0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
OTOL1A6NHN0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
OTOL1A6NHN0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
OTOL1A6NHN0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
OTOL1A6NHN0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
OTOL1A6NHN0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
OTOL1A6NHN0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
OTOL1A6NHN0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
OTOL1A6NHN0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
OTOL1A6NHN0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
OTOL1A6NHN0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
OTOL1A6NHN0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
OTOL1A6NHN0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
OTOL1A6NHN0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
OTOL1A6NHN0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
OTOL1A6NHN0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
OTOL1A6NHN0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
OTOL1A6NHN0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
OTOL1A6NHN0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
OTOL1A6NHN0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
OTOL1A6NHN0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
OTOL1A6NHN0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms