Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
STRCP1A6NGW2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
STRCP1A6NGW2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
STRCP1A6NGW2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
STRCP1A6NGW2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
STRCP1A6NGW2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
STRCP1A6NGW2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
STRCP1A6NGW2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
STRCP1A6NGW2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
STRCP1A6NGW2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
STRCP1A6NGW2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
STRCP1A6NGW2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
STRCP1A6NGW2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
STRCP1A6NGW2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
STRCP1A6NGW2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
STRCP1A6NGW2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
STRCP1A6NGW2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
STRCP1A6NGW2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
STRCP1A6NGW2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
STRCP1A6NGW2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
STRCP1A6NGW2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
STRCP1A6NGW2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
STRCP1A6NGW2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
STRCP1A6NGW2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
STRCP1A6NGW2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
STRCP1A6NGW2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
STRCP1A6NGW2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
STRCP1A6NGW2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
STRCP1A6NGW2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
STRCP1A6NGW2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
STRCP1A6NGW2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
STRCP1A6NGW2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
STRCP1A6NGW2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
STRCP1A6NGW2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
STRCP1A6NGW2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
STRCP1A6NGW2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
STRCP1A6NGW2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
STRCP1A6NGW2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
STRCP1A6NGW2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
STRCP1A6NGW2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
STRCP1A6NGW2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
STRCP1A6NGW2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
STRCP1A6NGW2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
STRCP1A6NGW2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
STRCP1A6NGW2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
STRCP1A6NGW2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
STRCP1A6NGW2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
STRCP1A6NGW2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC35.1■■■■□ 3.21
STRCP1A6NGW2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
STRCP1A6NGW2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
STRCP1A6NGW2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
STRCP1A6NGW2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
STRCP1A6NGW2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
STRCP1A6NGW2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.2
STRCP1A6NGW2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
STRCP1A6NGW2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
STRCP1A6NGW2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
STRCP1A6NGW2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
STRCP1A6NGW2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
STRCP1A6NGW2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
STRCP1A6NGW2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
STRCP1A6NGW2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
STRCP1A6NGW2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC35.05■■■■□ 3.2
STRCP1A6NGW2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC35.05■■■■□ 3.2
STRCP1A6NGW2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
STRCP1A6NGW2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
STRCP1A6NGW2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
STRCP1A6NGW2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
STRCP1A6NGW2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
STRCP1A6NGW2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
STRCP1A6NGW2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
STRCP1A6NGW2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
STRCP1A6NGW2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
STRCP1A6NGW2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
STRCP1A6NGW2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
STRCP1A6NGW2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
STRCP1A6NGW2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
STRCP1A6NGW2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
STRCP1A6NGW2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
STRCP1A6NGW2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
STRCP1A6NGW2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC35■■■■□ 3.19
STRCP1A6NGW2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
STRCP1A6NGW2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
STRCP1A6NGW2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
STRCP1A6NGW2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC35■■■■□ 3.19
STRCP1A6NGW2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
STRCP1A6NGW2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
STRCP1A6NGW2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
STRCP1A6NGW2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
STRCP1A6NGW2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
STRCP1A6NGW2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
STRCP1A6NGW2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
STRCP1A6NGW2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
STRCP1A6NGW2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
STRCP1A6NGW2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
STRCP1A6NGW2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
STRCP1A6NGW2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
STRCP1A6NGW2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
STRCP1A6NGW2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
STRCP1A6NGW2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms