Protein–RNA interactions for Protein: A6NGA9

TMEM202, Transmembrane protein 202, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM202A6NGA9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM202A6NGA9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM202A6NGA9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM202A6NGA9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM202A6NGA9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM202A6NGA9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM202A6NGA9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM202A6NGA9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM202A6NGA9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM202A6NGA9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM202A6NGA9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM202A6NGA9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM202A6NGA9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM202A6NGA9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM202A6NGA9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM202A6NGA9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM202A6NGA9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM202A6NGA9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM202A6NGA9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM202A6NGA9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM202A6NGA9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM202A6NGA9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM202A6NGA9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM202A6NGA9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM202A6NGA9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM202A6NGA9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM202A6NGA9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM202A6NGA9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM202A6NGA9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM202A6NGA9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM202A6NGA9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM202A6NGA9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM202A6NGA9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM202A6NGA9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM202A6NGA9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM202A6NGA9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM202A6NGA9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM202A6NGA9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM202A6NGA9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM202A6NGA9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM202A6NGA9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM202A6NGA9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM202A6NGA9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM202A6NGA9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM202A6NGA9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM202A6NGA9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM202A6NGA9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM202A6NGA9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM202A6NGA9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM202A6NGA9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM202A6NGA9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM202A6NGA9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM202A6NGA9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMEM202A6NGA9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMEM202A6NGA9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMEM202A6NGA9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMEM202A6NGA9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMEM202A6NGA9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM202A6NGA9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM202A6NGA9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM202A6NGA9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM202A6NGA9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM202A6NGA9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM202A6NGA9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM202A6NGA9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM202A6NGA9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM202A6NGA9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM202A6NGA9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM202A6NGA9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM202A6NGA9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM202A6NGA9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM202A6NGA9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM202A6NGA9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM202A6NGA9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM202A6NGA9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM202A6NGA9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM202A6NGA9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM202A6NGA9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM202A6NGA9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM202A6NGA9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM202A6NGA9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM202A6NGA9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM202A6NGA9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM202A6NGA9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM202A6NGA9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM202A6NGA9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM202A6NGA9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM202A6NGA9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM202A6NGA9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM202A6NGA9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM202A6NGA9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM202A6NGA9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM202A6NGA9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM202A6NGA9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM202A6NGA9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM202A6NGA9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM202A6NGA9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM202A6NGA9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM202A6NGA9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM202A6NGA9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms