Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GOLGA6L4A6NEF3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GOLGA6L4A6NEF3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GOLGA6L4A6NEF3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GOLGA6L4A6NEF3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GOLGA6L4A6NEF3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GOLGA6L4A6NEF3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GOLGA6L4A6NEF3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GOLGA6L4A6NEF3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GOLGA6L4A6NEF3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GOLGA6L4A6NEF3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GOLGA6L4A6NEF3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GOLGA6L4A6NEF3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GOLGA6L4A6NEF3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GOLGA6L4A6NEF3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GOLGA6L4A6NEF3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
GOLGA6L4A6NEF3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GOLGA6L4A6NEF3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GOLGA6L4A6NEF3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GOLGA6L4A6NEF3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GOLGA6L4A6NEF3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GOLGA6L4A6NEF3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GOLGA6L4A6NEF3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GOLGA6L4A6NEF3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GOLGA6L4A6NEF3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GOLGA6L4A6NEF3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GOLGA6L4A6NEF3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GOLGA6L4A6NEF3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GOLGA6L4A6NEF3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GOLGA6L4A6NEF3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GOLGA6L4A6NEF3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GOLGA6L4A6NEF3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GOLGA6L4A6NEF3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GOLGA6L4A6NEF3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GOLGA6L4A6NEF3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GOLGA6L4A6NEF3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GOLGA6L4A6NEF3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GOLGA6L4A6NEF3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GOLGA6L4A6NEF3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GOLGA6L4A6NEF3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GOLGA6L4A6NEF3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GOLGA6L4A6NEF3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GOLGA6L4A6NEF3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GOLGA6L4A6NEF3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GOLGA6L4A6NEF3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GOLGA6L4A6NEF3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GOLGA6L4A6NEF3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GOLGA6L4A6NEF3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GOLGA6L4A6NEF3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GOLGA6L4A6NEF3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GOLGA6L4A6NEF3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GOLGA6L4A6NEF3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GOLGA6L4A6NEF3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GOLGA6L4A6NEF3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GOLGA6L4A6NEF3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GOLGA6L4A6NEF3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GOLGA6L4A6NEF3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GOLGA6L4A6NEF3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
GOLGA6L4A6NEF3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GOLGA6L4A6NEF3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GOLGA6L4A6NEF3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GOLGA6L4A6NEF3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GOLGA6L4A6NEF3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GOLGA6L4A6NEF3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GOLGA6L4A6NEF3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GOLGA6L4A6NEF3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GOLGA6L4A6NEF3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GOLGA6L4A6NEF3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GOLGA6L4A6NEF3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GOLGA6L4A6NEF3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GOLGA6L4A6NEF3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GOLGA6L4A6NEF3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GOLGA6L4A6NEF3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GOLGA6L4A6NEF3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GOLGA6L4A6NEF3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GOLGA6L4A6NEF3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GOLGA6L4A6NEF3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GOLGA6L4A6NEF3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GOLGA6L4A6NEF3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
GOLGA6L4A6NEF3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GOLGA6L4A6NEF3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GOLGA6L4A6NEF3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GOLGA6L4A6NEF3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GOLGA6L4A6NEF3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
GOLGA6L4A6NEF3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
GOLGA6L4A6NEF3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GOLGA6L4A6NEF3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GOLGA6L4A6NEF3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GOLGA6L4A6NEF3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GOLGA6L4A6NEF3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GOLGA6L4A6NEF3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GOLGA6L4A6NEF3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GOLGA6L4A6NEF3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GOLGA6L4A6NEF3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms