Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MAP1LC3B2A6NCE7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MAP1LC3B2A6NCE7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MAP1LC3B2A6NCE7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MAP1LC3B2A6NCE7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MAP1LC3B2A6NCE7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MAP1LC3B2A6NCE7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MAP1LC3B2A6NCE7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MAP1LC3B2A6NCE7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MAP1LC3B2A6NCE7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MAP1LC3B2A6NCE7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MAP1LC3B2A6NCE7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MAP1LC3B2A6NCE7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MAP1LC3B2A6NCE7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MAP1LC3B2A6NCE7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MAP1LC3B2A6NCE7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MAP1LC3B2A6NCE7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MAP1LC3B2A6NCE7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MAP1LC3B2A6NCE7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
MAP1LC3B2A6NCE7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MAP1LC3B2A6NCE7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
MAP1LC3B2A6NCE7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MAP1LC3B2A6NCE7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MAP1LC3B2A6NCE7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
MAP1LC3B2A6NCE7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MAP1LC3B2A6NCE7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MAP1LC3B2A6NCE7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MAP1LC3B2A6NCE7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MAP1LC3B2A6NCE7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MAP1LC3B2A6NCE7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MAP1LC3B2A6NCE7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MAP1LC3B2A6NCE7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MAP1LC3B2A6NCE7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MAP1LC3B2A6NCE7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MAP1LC3B2A6NCE7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MAP1LC3B2A6NCE7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MAP1LC3B2A6NCE7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MAP1LC3B2A6NCE7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MAP1LC3B2A6NCE7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MAP1LC3B2A6NCE7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MAP1LC3B2A6NCE7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MAP1LC3B2A6NCE7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MAP1LC3B2A6NCE7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MAP1LC3B2A6NCE7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MAP1LC3B2A6NCE7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MAP1LC3B2A6NCE7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MAP1LC3B2A6NCE7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MAP1LC3B2A6NCE7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MAP1LC3B2A6NCE7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MAP1LC3B2A6NCE7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MAP1LC3B2A6NCE7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MAP1LC3B2A6NCE7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
MAP1LC3B2A6NCE7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MAP1LC3B2A6NCE7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MAP1LC3B2A6NCE7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MAP1LC3B2A6NCE7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MAP1LC3B2A6NCE7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
MAP1LC3B2A6NCE7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MAP1LC3B2A6NCE7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MAP1LC3B2A6NCE7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MAP1LC3B2A6NCE7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
MAP1LC3B2A6NCE7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MAP1LC3B2A6NCE7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MAP1LC3B2A6NCE7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MAP1LC3B2A6NCE7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MAP1LC3B2A6NCE7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
MAP1LC3B2A6NCE7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MAP1LC3B2A6NCE7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MAP1LC3B2A6NCE7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MAP1LC3B2A6NCE7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
MAP1LC3B2A6NCE7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MAP1LC3B2A6NCE7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MAP1LC3B2A6NCE7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MAP1LC3B2A6NCE7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MAP1LC3B2A6NCE7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MAP1LC3B2A6NCE7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MAP1LC3B2A6NCE7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MAP1LC3B2A6NCE7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MAP1LC3B2A6NCE7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MAP1LC3B2A6NCE7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MAP1LC3B2A6NCE7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MAP1LC3B2A6NCE7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MAP1LC3B2A6NCE7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MAP1LC3B2A6NCE7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
MAP1LC3B2A6NCE7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MAP1LC3B2A6NCE7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MAP1LC3B2A6NCE7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MAP1LC3B2A6NCE7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MAP1LC3B2A6NCE7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MAP1LC3B2A6NCE7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MAP1LC3B2A6NCE7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MAP1LC3B2A6NCE7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MAP1LC3B2A6NCE7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MAP1LC3B2A6NCE7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms