Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FRMD3A2A2Y4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
FRMD3A2A2Y4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FRMD3A2A2Y4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FRMD3A2A2Y4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FRMD3A2A2Y4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FRMD3A2A2Y4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FRMD3A2A2Y4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FRMD3A2A2Y4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FRMD3A2A2Y4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FRMD3A2A2Y4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FRMD3A2A2Y4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FRMD3A2A2Y4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
FRMD3A2A2Y4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FRMD3A2A2Y4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FRMD3A2A2Y4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FRMD3A2A2Y4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FRMD3A2A2Y4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FRMD3A2A2Y4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FRMD3A2A2Y4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
FRMD3A2A2Y4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FRMD3A2A2Y4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FRMD3A2A2Y4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
FRMD3A2A2Y4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
FRMD3A2A2Y4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FRMD3A2A2Y4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FRMD3A2A2Y4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FRMD3A2A2Y4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FRMD3A2A2Y4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FRMD3A2A2Y4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FRMD3A2A2Y4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FRMD3A2A2Y4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FRMD3A2A2Y4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FRMD3A2A2Y4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FRMD3A2A2Y4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FRMD3A2A2Y4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FRMD3A2A2Y4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FRMD3A2A2Y4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FRMD3A2A2Y4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FRMD3A2A2Y4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FRMD3A2A2Y4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FRMD3A2A2Y4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FRMD3A2A2Y4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FRMD3A2A2Y4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FRMD3A2A2Y4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FRMD3A2A2Y4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FRMD3A2A2Y4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FRMD3A2A2Y4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FRMD3A2A2Y4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FRMD3A2A2Y4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FRMD3A2A2Y4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FRMD3A2A2Y4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FRMD3A2A2Y4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
FRMD3A2A2Y4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FRMD3A2A2Y4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FRMD3A2A2Y4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FRMD3A2A2Y4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FRMD3A2A2Y4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
FRMD3A2A2Y4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FRMD3A2A2Y4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FRMD3A2A2Y4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FRMD3A2A2Y4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FRMD3A2A2Y4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FRMD3A2A2Y4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FRMD3A2A2Y4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FRMD3A2A2Y4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FRMD3A2A2Y4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FRMD3A2A2Y4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FRMD3A2A2Y4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FRMD3A2A2Y4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FRMD3A2A2Y4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FRMD3A2A2Y4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FRMD3A2A2Y4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FRMD3A2A2Y4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
FRMD3A2A2Y4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FRMD3A2A2Y4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FRMD3A2A2Y4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FRMD3A2A2Y4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FRMD3A2A2Y4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FRMD3A2A2Y4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FRMD3A2A2Y4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FRMD3A2A2Y4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FRMD3A2A2Y4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
FRMD3A2A2Y4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FRMD3A2A2Y4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FRMD3A2A2Y4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FRMD3A2A2Y4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
FRMD3A2A2Y4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FRMD3A2A2Y4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FRMD3A2A2Y4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FRMD3A2A2Y4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FRMD3A2A2Y4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FRMD3A2A2Y4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FRMD3A2A2Y4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FRMD3A2A2Y4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FRMD3A2A2Y4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FRMD3A2A2Y4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FRMD3A2A2Y4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FRMD3A2A2Y4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FRMD3A2A2Y4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.8 ms