Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PPC4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PPC4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A1W2PPC4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A1W2PPC4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A1W2PPC4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A1W2PPC4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A1W2PPC4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A1W2PPC4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A1W2PPC4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A1W2PPC4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A1W2PPC4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A1W2PPC4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A1W2PPC4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A1W2PPC4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A1W2PPC4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A1W2PPC4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A1W2PPC4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A1W2PPC4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A1W2PPC4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A1W2PPC4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A1W2PPC4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
A0A1W2PPC4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
A0A1W2PPC4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
A0A1W2PPC4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms