Protein–RNA interactions for Protein: O14618

CCS, Copper chaperone for superoxide dismutase, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSO14618 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCSO14618 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCSO14618 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCSO14618 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCSO14618 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCSO14618 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCSO14618 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCSO14618 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCSO14618 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCSO14618 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCSO14618 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCSO14618 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCSO14618 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCSO14618 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCSO14618 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCSO14618 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCSO14618 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCSO14618 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCSO14618 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCSO14618 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCSO14618 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCSO14618 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCSO14618 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCSO14618 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CCSO14618 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCSO14618 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCSO14618 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCSO14618 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCSO14618 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCSO14618 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCSO14618 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCSO14618 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCSO14618 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCSO14618 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCSO14618 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CCSO14618 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCSO14618 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCSO14618 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCSO14618 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCSO14618 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCSO14618 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCSO14618 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCSO14618 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCSO14618 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCSO14618 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCSO14618 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCSO14618 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCSO14618 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCSO14618 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCSO14618 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCSO14618 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCSO14618 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCSO14618 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCSO14618 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCSO14618 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCSO14618 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCSO14618 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CCSO14618 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CCSO14618 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCSO14618 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCSO14618 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCSO14618 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCSO14618 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CCSO14618 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCSO14618 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCSO14618 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCSO14618 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCSO14618 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCSO14618 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCSO14618 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCSO14618 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCSO14618 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCSO14618 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCSO14618 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CCSO14618 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CCSO14618 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
CCSO14618 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CCSO14618 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CCSO14618 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CCSO14618 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CCSO14618 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCSO14618 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCSO14618 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCSO14618 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCSO14618 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CCSO14618 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CCSO14618 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCSO14618 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCSO14618 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCSO14618 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCSO14618 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCSO14618 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCSO14618 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCSO14618 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CCSO14618 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCSO14618 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCSO14618 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCSO14618 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CCSO14618 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCSO14618 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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