Protein–RNA interactions for Protein: U3KQ54

PMF1-BGLAP, HCG2044777, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMF1-BGLAPU3KQ54 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PMF1-BGLAPU3KQ54 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PMF1-BGLAPU3KQ54 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PMF1-BGLAPU3KQ54 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PMF1-BGLAPU3KQ54 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PMF1-BGLAPU3KQ54 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PMF1-BGLAPU3KQ54 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PMF1-BGLAPU3KQ54 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PMF1-BGLAPU3KQ54 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PMF1-BGLAPU3KQ54 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PMF1-BGLAPU3KQ54 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PMF1-BGLAPU3KQ54 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PMF1-BGLAPU3KQ54 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PMF1-BGLAPU3KQ54 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PMF1-BGLAPU3KQ54 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PMF1-BGLAPU3KQ54 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PMF1-BGLAPU3KQ54 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PMF1-BGLAPU3KQ54 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PMF1-BGLAPU3KQ54 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PMF1-BGLAPU3KQ54 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PMF1-BGLAPU3KQ54 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PMF1-BGLAPU3KQ54 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PMF1-BGLAPU3KQ54 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PMF1-BGLAPU3KQ54 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMF1-BGLAPU3KQ54 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMF1-BGLAPU3KQ54 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMF1-BGLAPU3KQ54 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMF1-BGLAPU3KQ54 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMF1-BGLAPU3KQ54 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMF1-BGLAPU3KQ54 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMF1-BGLAPU3KQ54 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMF1-BGLAPU3KQ54 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMF1-BGLAPU3KQ54 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMF1-BGLAPU3KQ54 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMF1-BGLAPU3KQ54 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMF1-BGLAPU3KQ54 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMF1-BGLAPU3KQ54 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMF1-BGLAPU3KQ54 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMF1-BGLAPU3KQ54 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PMF1-BGLAPU3KQ54 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMF1-BGLAPU3KQ54 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMF1-BGLAPU3KQ54 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMF1-BGLAPU3KQ54 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMF1-BGLAPU3KQ54 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMF1-BGLAPU3KQ54 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMF1-BGLAPU3KQ54 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMF1-BGLAPU3KQ54 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMF1-BGLAPU3KQ54 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMF1-BGLAPU3KQ54 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMF1-BGLAPU3KQ54 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMF1-BGLAPU3KQ54 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMF1-BGLAPU3KQ54 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMF1-BGLAPU3KQ54 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMF1-BGLAPU3KQ54 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PMF1-BGLAPU3KQ54 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMF1-BGLAPU3KQ54 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMF1-BGLAPU3KQ54 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMF1-BGLAPU3KQ54 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMF1-BGLAPU3KQ54 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PMF1-BGLAPU3KQ54 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PMF1-BGLAPU3KQ54 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PMF1-BGLAPU3KQ54 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMF1-BGLAPU3KQ54 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMF1-BGLAPU3KQ54 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMF1-BGLAPU3KQ54 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMF1-BGLAPU3KQ54 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMF1-BGLAPU3KQ54 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMF1-BGLAPU3KQ54 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMF1-BGLAPU3KQ54 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMF1-BGLAPU3KQ54 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMF1-BGLAPU3KQ54 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMF1-BGLAPU3KQ54 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMF1-BGLAPU3KQ54 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMF1-BGLAPU3KQ54 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMF1-BGLAPU3KQ54 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMF1-BGLAPU3KQ54 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMF1-BGLAPU3KQ54 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMF1-BGLAPU3KQ54 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMF1-BGLAPU3KQ54 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMF1-BGLAPU3KQ54 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMF1-BGLAPU3KQ54 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMF1-BGLAPU3KQ54 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PMF1-BGLAPU3KQ54 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PMF1-BGLAPU3KQ54 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PMF1-BGLAPU3KQ54 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMF1-BGLAPU3KQ54 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMF1-BGLAPU3KQ54 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMF1-BGLAPU3KQ54 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PMF1-BGLAPU3KQ54 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PMF1-BGLAPU3KQ54 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PMF1-BGLAPU3KQ54 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PMF1-BGLAPU3KQ54 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PMF1-BGLAPU3KQ54 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PMF1-BGLAPU3KQ54 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PMF1-BGLAPU3KQ54 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PMF1-BGLAPU3KQ54 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PMF1-BGLAPU3KQ54 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms