Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6B7

AP4B1, AP-4 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4B1Q9Y6B7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AP4B1Q9Y6B7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AP4B1Q9Y6B7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AP4B1Q9Y6B7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AP4B1Q9Y6B7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AP4B1Q9Y6B7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AP4B1Q9Y6B7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AP4B1Q9Y6B7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AP4B1Q9Y6B7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AP4B1Q9Y6B7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AP4B1Q9Y6B7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AP4B1Q9Y6B7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AP4B1Q9Y6B7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AP4B1Q9Y6B7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AP4B1Q9Y6B7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AP4B1Q9Y6B7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AP4B1Q9Y6B7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AP4B1Q9Y6B7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AP4B1Q9Y6B7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AP4B1Q9Y6B7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AP4B1Q9Y6B7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AP4B1Q9Y6B7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AP4B1Q9Y6B7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP4B1Q9Y6B7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP4B1Q9Y6B7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP4B1Q9Y6B7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP4B1Q9Y6B7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP4B1Q9Y6B7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP4B1Q9Y6B7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP4B1Q9Y6B7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP4B1Q9Y6B7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP4B1Q9Y6B7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP4B1Q9Y6B7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
AP4B1Q9Y6B7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP4B1Q9Y6B7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
AP4B1Q9Y6B7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP4B1Q9Y6B7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP4B1Q9Y6B7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP4B1Q9Y6B7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP4B1Q9Y6B7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP4B1Q9Y6B7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AP4B1Q9Y6B7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AP4B1Q9Y6B7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AP4B1Q9Y6B7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AP4B1Q9Y6B7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AP4B1Q9Y6B7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP4B1Q9Y6B7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP4B1Q9Y6B7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP4B1Q9Y6B7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP4B1Q9Y6B7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP4B1Q9Y6B7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP4B1Q9Y6B7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP4B1Q9Y6B7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP4B1Q9Y6B7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP4B1Q9Y6B7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP4B1Q9Y6B7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP4B1Q9Y6B7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP4B1Q9Y6B7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP4B1Q9Y6B7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP4B1Q9Y6B7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP4B1Q9Y6B7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP4B1Q9Y6B7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP4B1Q9Y6B7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP4B1Q9Y6B7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP4B1Q9Y6B7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP4B1Q9Y6B7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
AP4B1Q9Y6B7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP4B1Q9Y6B7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP4B1Q9Y6B7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP4B1Q9Y6B7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP4B1Q9Y6B7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP4B1Q9Y6B7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP4B1Q9Y6B7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP4B1Q9Y6B7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP4B1Q9Y6B7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP4B1Q9Y6B7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
AP4B1Q9Y6B7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AP4B1Q9Y6B7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AP4B1Q9Y6B7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AP4B1Q9Y6B7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
AP4B1Q9Y6B7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP4B1Q9Y6B7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP4B1Q9Y6B7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP4B1Q9Y6B7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP4B1Q9Y6B7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
AP4B1Q9Y6B7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP4B1Q9Y6B7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
AP4B1Q9Y6B7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
AP4B1Q9Y6B7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP4B1Q9Y6B7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP4B1Q9Y6B7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP4B1Q9Y6B7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP4B1Q9Y6B7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AP4B1Q9Y6B7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
AP4B1Q9Y6B7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AP4B1Q9Y6B7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AP4B1Q9Y6B7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AP4B1Q9Y6B7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AP4B1Q9Y6B7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP4B1Q9Y6B7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms