Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y561

LRP12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP12Q9Y561 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRP12Q9Y561 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRP12Q9Y561 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRP12Q9Y561 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRP12Q9Y561 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRP12Q9Y561 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LRP12Q9Y561 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRP12Q9Y561 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRP12Q9Y561 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRP12Q9Y561 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRP12Q9Y561 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRP12Q9Y561 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRP12Q9Y561 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRP12Q9Y561 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRP12Q9Y561 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRP12Q9Y561 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRP12Q9Y561 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRP12Q9Y561 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRP12Q9Y561 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRP12Q9Y561 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRP12Q9Y561 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRP12Q9Y561 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRP12Q9Y561 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRP12Q9Y561 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRP12Q9Y561 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRP12Q9Y561 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRP12Q9Y561 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRP12Q9Y561 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRP12Q9Y561 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRP12Q9Y561 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRP12Q9Y561 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRP12Q9Y561 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRP12Q9Y561 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRP12Q9Y561 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRP12Q9Y561 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRP12Q9Y561 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRP12Q9Y561 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRP12Q9Y561 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRP12Q9Y561 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRP12Q9Y561 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRP12Q9Y561 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRP12Q9Y561 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRP12Q9Y561 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRP12Q9Y561 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRP12Q9Y561 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRP12Q9Y561 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRP12Q9Y561 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRP12Q9Y561 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRP12Q9Y561 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRP12Q9Y561 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRP12Q9Y561 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRP12Q9Y561 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LRP12Q9Y561 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LRP12Q9Y561 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LRP12Q9Y561 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LRP12Q9Y561 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LRP12Q9Y561 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LRP12Q9Y561 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LRP12Q9Y561 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LRP12Q9Y561 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LRP12Q9Y561 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRP12Q9Y561 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRP12Q9Y561 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRP12Q9Y561 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRP12Q9Y561 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRP12Q9Y561 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRP12Q9Y561 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRP12Q9Y561 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRP12Q9Y561 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRP12Q9Y561 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRP12Q9Y561 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRP12Q9Y561 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRP12Q9Y561 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRP12Q9Y561 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRP12Q9Y561 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LRP12Q9Y561 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRP12Q9Y561 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRP12Q9Y561 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRP12Q9Y561 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LRP12Q9Y561 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRP12Q9Y561 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRP12Q9Y561 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRP12Q9Y561 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRP12Q9Y561 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRP12Q9Y561 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRP12Q9Y561 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRP12Q9Y561 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRP12Q9Y561 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRP12Q9Y561 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRP12Q9Y561 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRP12Q9Y561 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRP12Q9Y561 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRP12Q9Y561 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRP12Q9Y561 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRP12Q9Y561 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRP12Q9Y561 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRP12Q9Y561 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRP12Q9Y561 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRP12Q9Y561 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRP12Q9Y561 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.3 ms