Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y547

HSPB11, Intraflagellar transport protein 25 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB11Q9Y547 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HSPB11Q9Y547 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HSPB11Q9Y547 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HSPB11Q9Y547 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HSPB11Q9Y547 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HSPB11Q9Y547 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HSPB11Q9Y547 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HSPB11Q9Y547 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HSPB11Q9Y547 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HSPB11Q9Y547 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HSPB11Q9Y547 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HSPB11Q9Y547 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HSPB11Q9Y547 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HSPB11Q9Y547 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HSPB11Q9Y547 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HSPB11Q9Y547 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HSPB11Q9Y547 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HSPB11Q9Y547 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HSPB11Q9Y547 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HSPB11Q9Y547 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HSPB11Q9Y547 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HSPB11Q9Y547 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HSPB11Q9Y547 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HSPB11Q9Y547 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HSPB11Q9Y547 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HSPB11Q9Y547 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HSPB11Q9Y547 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HSPB11Q9Y547 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HSPB11Q9Y547 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HSPB11Q9Y547 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HSPB11Q9Y547 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HSPB11Q9Y547 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HSPB11Q9Y547 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HSPB11Q9Y547 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HSPB11Q9Y547 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HSPB11Q9Y547 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HSPB11Q9Y547 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HSPB11Q9Y547 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HSPB11Q9Y547 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HSPB11Q9Y547 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HSPB11Q9Y547 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HSPB11Q9Y547 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HSPB11Q9Y547 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
HSPB11Q9Y547 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HSPB11Q9Y547 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HSPB11Q9Y547 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HSPB11Q9Y547 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HSPB11Q9Y547 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HSPB11Q9Y547 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HSPB11Q9Y547 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HSPB11Q9Y547 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HSPB11Q9Y547 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HSPB11Q9Y547 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HSPB11Q9Y547 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HSPB11Q9Y547 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HSPB11Q9Y547 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HSPB11Q9Y547 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HSPB11Q9Y547 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HSPB11Q9Y547 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HSPB11Q9Y547 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HSPB11Q9Y547 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HSPB11Q9Y547 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HSPB11Q9Y547 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HSPB11Q9Y547 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HSPB11Q9Y547 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HSPB11Q9Y547 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HSPB11Q9Y547 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HSPB11Q9Y547 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HSPB11Q9Y547 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HSPB11Q9Y547 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HSPB11Q9Y547 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HSPB11Q9Y547 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HSPB11Q9Y547 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HSPB11Q9Y547 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HSPB11Q9Y547 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HSPB11Q9Y547 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HSPB11Q9Y547 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HSPB11Q9Y547 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HSPB11Q9Y547 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HSPB11Q9Y547 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HSPB11Q9Y547 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HSPB11Q9Y547 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HSPB11Q9Y547 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HSPB11Q9Y547 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HSPB11Q9Y547 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HSPB11Q9Y547 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HSPB11Q9Y547 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HSPB11Q9Y547 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HSPB11Q9Y547 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HSPB11Q9Y547 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HSPB11Q9Y547 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
HSPB11Q9Y547 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HSPB11Q9Y547 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HSPB11Q9Y547 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HSPB11Q9Y547 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HSPB11Q9Y547 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HSPB11Q9Y547 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HSPB11Q9Y547 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HSPB11Q9Y547 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HSPB11Q9Y547 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms